当前解析结果
SmilChr05G000902| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000902 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000902 |
| 描述 | putative cyclin-D6-1 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7148363 - 7150360 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985615 |
|---|---|
| GeneID | 130985615 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985615 |
| 原始查询 | SmilChr05G000902 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative cyclin-D6-1 |
| 产物 | putative cyclin-D6-1 |
| Arabidopsis | AT4G03270 (CYCD6;1)Cyclin D6;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828000] identity=44.8; qcov=0.804; evalue=1e-50; confidence=medium |
| Rice | Os07g0556000 (CycD6)- identity=35; qcov=0.895; evalue=1.07e-36; confidence=low |
| GO | GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985615 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764668.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764668.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764668.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764668.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057764668.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764668.1PF00134
Cyclin_N 23-144 aa
PF02984
Cyclin_C 146-247 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764668.1 |
Pfam | PF00134 |
Cyclin_N | Domain | 23 | 144 | 3.3e-17 | 63.1 | Cyclin, N-terminal domain |
XP_057764668.1 |
Pfam | PF02984 |
Cyclin_C | Domain | 146 | 247 | 9.2e-09 | 36.1 | Cyclin, C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。