当前解析结果
SmilChr05G000918| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000918 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000918 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000918 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7284603 - 7285698 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025467 |
|---|---|
| GeneID | 131025467 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025467 |
| 原始查询 | SmilChr05G000918 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025467 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811246.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811246.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057811246.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811246.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811246.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:7284811 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr5:7284815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B78 |
Chr5:7284815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr5:7284881 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C35 |
Chr5:7284892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B130,B79,C60 |
Chr5:7284913 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,C31 |
Chr5:7284946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B133,B4,C19 |
Chr5:7284953 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C27,C83 |
Chr5:7284980 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A22,B21,B44,C55 |
Chr5:7284980 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | A22,B21,B44,C55 |
Chr5:7284982 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr5:7284985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,C35,C85,D8 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057811246.1PF09331
DUF1985 28-158 aa
PF29561
DUF8566 31-181 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057811246.1 |
Pfam | PF09331 |
DUF1985 | Family | 28 | 158 | 7.8e-14 | 52.6 | Domain of unknown function (DUF1985) |
XP_057811246.1 |
Pfam | PF29561 |
DUF8566 | Domain | 31 | 181 | 4.2e-09 | 37.2 | Domain of unknown function (DUF8566) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。