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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000925`

染色体: Chr05 坐标: 7356587-7359309 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000925`
名称	SmilChr05G000925
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-13
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7356587 - 7359309 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985636`
GeneID	`130985636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985636`
原始查询	`SmilChr05G000925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-13
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-13
Arabidopsis	`AT1G11330` (AT1G11330) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837675] identity=51.3; qcov=1; evalue=2.63e-163; confidence=high
Rice	`Os01g0783800` - identity=49.1; qcov=0.996; evalue=1.31e-142; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2); PF11883 (DUF3403)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764692.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764692.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764692.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764692.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7357008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:7357328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr5:7357354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B73
`Chr5:7357560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B27,B65
`Chr5:7357862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B16,C30,C43,D2
`Chr5:7358108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C20,C51
`Chr5:7358507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B28
`Chr5:7358890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B75,C18,D3
`Chr5:7358892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764692.1

564 aa

282

564

S_locus_glycop

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

DUF3403

PF00954 S_locus_glycop 25-59 aa PF08276 PAN_2 81-142 aa PF00069 Pkinase 250-446 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 251-515 aa PF11883 DUF3403 518-564 aa

XP_057764693.1

470 aa

235

470

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

DUF3403

PF08276 PAN_2 14-48 aa PF00069 Pkinase 156-352 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 157-421 aa PF11883 DUF3403 424-470 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764692.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	25	59	2.5e-06	28.7	S-locus glycoprotein domain
`XP_057764692.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	81	142	1e-09	39.0	PAN-like domain
`XP_057764692.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	250	446	4.3e-46	158.2	Protein kinase domain
`XP_057764692.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	251	515	1.2e-49	169.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057764692.1`	Pfam	`PF11883`	DUF3403	Family	518	564	1.4e-07	32.2	Domain of unknown function (DUF3403)
`XP_057764693.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	14	48	5.3e-08	33.6	PAN-like domain
`XP_057764693.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	156	352	2.9e-46	158.7	Protein kinase domain
`XP_057764693.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	157	421	7.4e-50	170.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057764693.1`	Pfam	`PF11883`	DUF3403	Family	424	470	1.1e-07	32.5	Domain of unknown function (DUF3403)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908709.1
GACCGAGTTGGGAGACCAGCATTACAAAAAATACTAATGTTAAGTGGGGTCAACGGCTGGCATTCGAAATTGGTTCAGTTGAGTCCACATCTCAAAATTTGTTAACAGCACACGGAATTCAGTTAGTGAAAGGCAAGTAGGAATTCGACGATGATGATGCATCTCAACTTTGCTCTTGTGATTTTGTTATGCCCCTGGTTTTGCAGGGCGCAGGTGAACAACACATCCGGCGACCCTTGCCAGACTCCCGGCAGGTGTGG...

XM_057908710.1
ACAAAAAATACTAATGTTAAGTGGGGTCAACGGCTGGCATTCGAAATTGGTTCAGTTGAGTCCACATCTCAAAATTTGTTAACAGCACACGGAATTCAGTTAGTGAAAGGGCGCAGGTGAACAACACATCCGGCGACCCTTGCCAGACTCCCGGCAGGTGTGGCGAATTCGGGGTGTGCTACCAAAGGGACTCCCCGATTTGTTCTTGTTTGCCGGGATTTGAGCCGCGGATCAATCAGGAATGGGATTCCGGAAACTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985636
ATGATGATGCATCTCAACTTTGCTCTTGTGATTTTGTTATGCCCCTGGTTTTGCAGGGCGCAGGTGAACAACACATCCGGCGACCCTTGCCAGACTCCCGGCAGGTGTGGCGAATTCGGGGTGTGCTACCAAAGGGACTCCCCGATTTGTTCTTGTTTGCCGGGATTTGAGCCGCGGATCAATCAGGAATGGGATTCCGGAAACTGGAGCAGCGGCTGTGTGAGGAGCTCCCCTTTGAACTGTAATAACGCCACCACCAC...

LOC130985636
ATGATCATAGTCACGGTTAATGAGGATTGGCGCCCCGGCTCCGAAGCTCAGTGCAAAACCCGATGCCGCACCAACTGCTCCTGCCTTGCCTACGGCTTCGACGGCGGTCGTGGCTGTAGATTGTGGGCTGGAACCTTAAACAACATTCAGAAATTCCCCAGCAACTCCGGCTCTAATCTTTATATCCGCCTCGCTAATTCCGAAATAGATCAAAAGAAAGACTCTAAGAAGATTATCATCATTGTAGTGGTTGTGGTTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764692.1
MMMHLNFALVILLCPWFCRAQVNNTSGDPCQTPGRCGEFGVCYQRDSPICSCLPGFEPRINQEWDSGNWSSGCVRSSPLNCNNATTTDGFSKVQMIIVTVNEDWRPGSEAQCKTRCRTNCSCLAYGFDGGRGCRLWAGTLNNIQKFPSNSGSNLYIRLANSEIDQKKDSKKIIIIVVVVVFFIASICACVSWKWIAARRGKKKSSQLGKQDPSFLADSSLQDVLSQVNLEELPLFKFETVANATNNFFEDSKLGKGGFGS...

XP_057764693.1
MIIVTVNEDWRPGSEAQCKTRCRTNCSCLAYGFDGGRGCRLWAGTLNNIQKFPSNSGSNLYIRLANSEIDQKKDSKKIIIIVVVVVFFIASICACVSWKWIAARRGKKKSSQLGKQDPSFLADSSLQDVLSQVNLEELPLFKFETVANATNNFFEDSKLGKGGFGSVYKGELVDGREIAVKRLSQASTQGMQEFMNELVLISKLQHRNLVRLIGCCIENKEKMLIYEYMPNKSLDFYLFDHSQQILDWRKRFNVIQGICR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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