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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000928`

染色体: Chr05 坐标: 7420557-7422392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000928`
名称	SmilChr05G000928
描述	U-box domain-containing protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7420557 - 7422392 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985643`
GeneID	`130985643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985643`
原始查询	`SmilChr05G000928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 8-like
产物	U-box domain-containing protein 8-like
Arabidopsis	`AT4G21350` (PUB8) plant U-box 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827885] identity=58.8; qcov=1; evalue=3.21e-149; confidence=high
Rice	`Os03g0275900` (OsPUB10) - identity=33.3; qcov=1.03; evalue=2.09e-58; confidence=low
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF04564 (U-box); PF11789 (zf-Nse); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764696.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764696.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764696.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764696.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764696.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7421452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:7421490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C8
`Chr5:7421595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:7421671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B82
`Chr5:7421671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:7421678`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C52
`Chr5:7421678`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C52
`Chr5:7421961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B50,C26,C50,D10
`Chr5:7422039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764696.1

368 aa

184

368

U-box

zf-Nse

zf-RING_UBOX

ARM_PUB

PF04564 U-box 6-72 aa PF11789 zf-Nse 8-48 aa PF13445 zf-RING_UBOX 11-47 aa PF25598 ARM_PUB 103-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764696.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	6	72	2.1e-19	70.1	U-box domain
`XP_057764696.1`	Pfam	`PF11789`	zf-Nse	Domain	8	48	9.7e-07	29.3	Zinc-finger of the MIZ type in Nse subunit
`XP_057764696.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	11	47	1.8e-07	31.8	RING-type zinc-finger
`XP_057764696.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	103	362	4.8e-17	63.0	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908713.1
AATTGAATTCGTAGATAGCTGTCCTGTCCATAACTTTTAGTAGTAATGTCTATTGGATCGTTTTGTAACAGTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCCAATTAAACATCAAATCAAGTATGAAACAGCCTCATATAGGACGTAGCTAGTGCAGATATTATGTGTATATTGGGGAAAAAACAAAAGAAAAGAATATACAAGAATTTAATTAAAAAAATTAGGGGCAGTAGCGTAATTGACGTAGTGAGTGGAGAGAGAGAGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985643
ATGGCCGTTGAGTTACCGGACGATTTCAAATGCCCCATTTCTTTAGAGATAATGTCTGACCCCGTCATCCTCTCCTCCGGCCACACCTTCGATCGCGCCTCCATTCAGCAGTGGCTCGACGCTGGGCACCGCTCCTGTCCAATTACGAAACTGCCCCTGCCGGAACCCCCTTCCCTCATTCCCAACCACGCCCTCCGCAGCCTCATTTCTAATTACACCCTCCTCTCCTTGCCTAAACCCCACCACCCCCACCCACCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764696.1
MAVELPDDFKCPISLEIMSDPVILSSGHTFDRASIQQWLDAGHRSCPITKLPLPEPPSLIPNHALRSLISNYTLLSLPKPHHPHPPNPQALIQLLISPSSQLEDKLNSLDQLSRLCKRDSAIRRRLAESGAVSAVLNCIDSGEPGLQEKALHFVLNLSLDDDSKVGLVAEGIVGKVVYALHCGVGDSRAVAATVLTSLAVLEVNKVTIGSYPDAIPGLVSLLQMGTSRERKEAATALFTLCSFSENRVRAIQCGAVPILI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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