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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000934`

染色体: Chr05 坐标: 7487465-7489226 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000934`
名称	SmilChr05G000934
描述	uncharacterized SmilChr05G000934
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7487465 - 7489226 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985650`
GeneID	`130985650`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985650`
原始查询	`SmilChr05G000934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine protease, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835541]; symbol=AT5G54530; hit=AT5G54530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	serine protease, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835541]; symbol=AT5G54530; hit=AT5G54530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G54530` (AT5G54530) serine protease, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835541] identity=62.2; qcov=0.808; evalue=1.36e-53; confidence=high
Rice	`Os01g0913100` - identity=40.5; qcov=0.695; evalue=5.11e-25; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985650

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764702.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057764702.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057764702.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057764702.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764702.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7488504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr5:7488721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,B41
`Chr5:7488892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B16,B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764702.1

191 aa

191

DUF538

PF04398 DUF538 61-169 aa

XP_057764703.1

189 aa

189

DUF538

PF04398 DUF538 59-167 aa

XP_057764704.1

167 aa

167

DUF538

PF04398 DUF538 37-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764702.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	61	169	5e-27	95.3	Protein of unknown function, DUF538
`XP_057764703.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	59	167	4.8e-27	95.4	Protein of unknown function, DUF538
`XP_057764704.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	37	145	3.6e-27	95.8	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908720.1
TTCGGTTAATCTAAATAATTGACCGGGTTAATCGATATCCAAAATTTATGAAAAACTGATAAACAAACTTGAATCAATATCCGAAATTTTTGGTTATTGGATAACCAAATGCGAACGGTTCTATTTGGTTATTGGATTATCCAAAATCCGATATCCATTTAGACAGCCGTAGACACCATGTTGAGATATGCGAGGTTTATATAACATATTATTTTTTTGAAAAAAAAAAAGATTCTTATTTTTTATGTTGGGGCAATGTG...

XM_057908721.1
CGGTTAATCTAAATAATTGACCGGGTTAATCGATATCCAAAATTTATGAAAAACTGATAAACAAACTTGAATCAATATCCGAAATTTTTGGTTATTGGATAACCAAATGCGAACGGTTCTATTTGGTTATTGGATTATCCAAAATCCGATATCCATTTAGACAGCCGTAGACACCATGTTGAGATATGCGAGGTTTATATAACATATTATTTTTTTGAAAAAAAAAAAGATTCTTATTTTTTATGTTGGGGCAATGTGAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985650
ATGGGACTGGCTGAAAAGAAATGCCACGCAATTGATACCGCGCATCATCTTTCCTTTTCGCATGATTTCCTTACCACCCTCTCCAGAGCAGCAGCAGCAGTGATGGCTATGCTACACAGAATAATTATTTCTGTGAGTGTGATTGTTTTGTGTTGGACGACGGCGTCGGGCTCCATTCATGAGCTGCTGAGAAGCAGAGGGTTGCCGGCGGGGCTATTTCCGAAGAACGGCGTGAAATCTTATGAACTGAGTGAAGATGG...

LOC130985650
ATGATTTCCTTACCACCCTCTCCAGCAGCAGCAGTGATGGCTATGCTACACAGAATAATTATTTCTGTGAGTGTGATTGTTTTGTGTTGGACGACGGCGTCGGGCTCCATTCATGAGCTGCTGAGAAGCAGAGGGTTGCCGGCGGGGCTATTTCCGAAGAACGGCGTGAAATCTTATGAACTGAGTGAAGATGGGTTGCTGCAGGTGTTCCTGGAGAGCCCCTGCGTGGCCAAACTGGAGACGAGGATATCGTTCGAGAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764702.1
MRLIWEKIHDVVPTFLHTTILAPFISSFLSRAAAAVMAMLHRIIISVSVIVLCWTTASGSIHELLRSRGLPAGLFPKNGVKSYELSEDGLLQVFLESPCVAKLETRISFESVVRANLSYGGLMGVEGLSQEELFLWLPVKDIIVYDPSSGLILFDIGLAHKQMSLSLFEDPPLCYPRFGLMDRRSGFRVQR

XP_057764703.1
MGLAEKKCHAIDTAHHLSFSHDFLTTLSRAAAAVMAMLHRIIISVSVIVLCWTTASGSIHELLRSRGLPAGLFPKNGVKSYELSEDGLLQVFLESPCVAKLETRISFESVVRANLSYGGLMGVEGLSQEELFLWLPVKDIIVYDPSSGLILFDIGLAHKQMSLSLFEDPPLCYPRFGLMDRRSGFRVQR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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