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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000945`

染色体: Chr05 坐标: 7641067-7644362 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000945`
名称	SmilChr05G000945
描述	putative FBD-associated F-box protein At1g61330
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7641067 - 7644362 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025468`
GeneID	`131025468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025468`
原始查询	`SmilChr05G000945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative FBD-associated F-box protein At1g61330
产物	putative FBD-associated F-box protein At1g61330
Arabidopsis	`AT1G61330` (AT1G61330) FBD, F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842427] identity=29.1; qcov=0.904; evalue=6.4e-46; confidence=low
Rice	`Os06g0139000` - identity=26; qcov=0.656; evalue=4.99e-15; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811247.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811247.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811247.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811247.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811247.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7641102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B57,C5
`Chr5:7641113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B134,B36,B57,C5
`Chr5:7641141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:7641545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,C8
`Chr5:7641563`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr5:7641563`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr5:7641696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B104
`Chr5:7644251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B47,C5
`Chr5:7644349`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr5:7644349`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811247.1

457 aa

228

457

F-box-like

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF12937 F-box-like 15-46 aa PF00646 F-box 15-52 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 79-411 aa PF24758 LRR_At5g56370 105-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811247.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	15	46	4e-07	30.4	F-box-like
`XP_057811247.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	52	3.7e-10	40.0	F-box domain
`XP_057811247.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	79	411	1.7e-21	77.8	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057811247.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	105	240	3.3e-10	40.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955264.1
ATGGCTCTTGTTCCATTCTCTCCCAACAAAAAAACGAAACCAATAAGTGACATGCCTGAAGATGTTATCGAGAAGATTTTCTCATTTCTTCCATTCAAAAAGCTGTGCAGCCTCTGTATTGTATCAAAAAGATTCAGAAATTCCTGGAAATTCTGCCGGGACCTCTCTTTCGACAGCGATGTAGCCAAGAATCTGTCTCGAGACGAATACAGAAACATGGTCGACAATTTCTTCAACAATCATTCAAGCATTTGCGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025468
ATGGCTCTTGTTCCATTCTCTCCCAACAAAAAAACGAAACCAATAAGTGACATGCCTGAAGATGTTATCGAGAAGATTTTCTCATTTCTTCCATTCAAAAAGCTGTGCAGCCTCTGTATTGTATCAAAAAGATTCAGAAATTCCTGGAAATTCTGCCGGGACCTCTCTTTCGACAGCGATGTAGCCAAGAATCTGTCTCGAGACGAATACAGAAACATGGTCGACAATTTCTTCAACAATCATTCAAGCATTTGCGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811247.1
MALVPFSPNKKTKPISDMPEDVIEKIFSFLPFKKLCSLCIVSKRFRNSWKFCRDLSFDSDVAKNLSRDEYRNMVDNFFNNHSSICADRLKLQYDASDEGNLISFWVGKAIRLGIKELELNLTQTHEKLSLNYDLVDVETLKTLKLVNCELHLPLNSNGLRHLREMTLQNVMAPPMVTDSIFRNCVSLRVLRLVRCSLVYSVRAIGKLGFEVLVVKDCCDVHSIEIDSPCLRRFHYHGKIMELRFGCEMQCLSDVVLDVAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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