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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000953`

染色体: Chr05 坐标: 7693114-7695150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000953`
名称	SmilChr05G000953
描述	vacuolar protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7693114 - 7695150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985668`
GeneID	`130985668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985668`
原始查询	`SmilChr05G000953`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein 8-like
产物	vacuolar protein 8-like
Arabidopsis	`AT1G61350` (AT1G61350) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842429] identity=49.3; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0560300` - identity=42.3; qcov=1.01; evalue=8.55e-140; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF23005 (DUF7032); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057764728.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057764728.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057764728.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764728.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7693408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B18,B73,B97
`Chr5:7693474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C19,C21,C26,C27,D11
`Chr5:7693480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:7693547`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B103
`Chr5:7693547`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B103
`Chr5:7693684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B85,B86,C31
`Chr5:7693969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A3,B105,B107,B114,B117,B129,B135,B15,B48,B55,B56,B6,B86,B98,C21,C35,C50,C60,C64,C67,C87,D4,D5
`Chr5:7693995`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B107,B129
`Chr5:7693995`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B107,B129
`Chr5:7694000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B129
`Chr5:7694095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,C16,C25,C53
`Chr5:7694167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B73,C42,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764728.1

552 aa

276

552

DUF7032

ARM_PUB

Arm

PF23005 DUF7032 8-110 aa PF25598 ARM_PUB 246-490 aa PF00514 Arm 335-374 aa PF00514 Arm 419-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764728.1`	Pfam	`PF23005`	DUF7032	Domain	8	110	5.4e-31	107.5	Domain of unknown function (DUF7032)
`XP_057764728.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	246	490	8.3e-11	42.6	Plant U-box protein ARM repeat region
`XP_057764728.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	335	374	3.7e-29	100.5	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057764728.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	419	455	3.7e-29	100.5	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908745.1
TACGAGGTGTGAGTGGTGATAGCTTGTGATAATATCTTCCAATTATGCGGAATTAAAGTGAAGCACATGCAGTCTGTTAGAAACCACAAAAGATAAGCATCTTCCAAAATTAAAATGGGTGAAGAAAACAGCGAAGCTATTCTGCTGATTTCTTCACTGATTTCTGCGTCCCATTCCATCAAAGTGTTCTCCGCCAAATGGCAATCCATCCGACACAAACTGGAGGAGCTCTTCTCCAACCTCGCCGCCATCCACAACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985668
ATGGGTGAAGAAAACAGCGAAGCTATTCTGCTGATTTCTTCACTGATTTCTGCGTCCCATTCCATCAAAGTGTTCTCCGCCAAATGGCAATCCATCCGACACAAACTGGAGGAGCTCTTCTCCAACCTCGCCGCCATCCACAACTGGGAATCCGCACTCCCTGCAGTTTCACACTCCATCTTAGCCACTCTCAACCACTGCCACCAGCTCGCCAAGCAGTGCTTGGACCTCTCATACAGCGGGAAGCTGCTTATGCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764728.1
MGEENSEAILLISSLISASHSIKVFSAKWQSIRHKLEELFSNLAAIHNWESALPAVSHSILATLNHCHQLAKQCLDLSYSGKLLMQSDLDIVSAKIDAHINNIFDVYAAGLLTRTDAIVVSRPTAAASRDDVRFYVVDLLSRFKIGSTDMKKQALLAFNQVIQEDERYITVALRLDNFVGFLVNFLDFKDGEIQQEAAKCVCLIAGSESWKSALIGAGAIAPLIRVVESGNEASKELAATCLLLLTENSDNAWLVSAHGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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