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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000969`

染色体: Chr05 坐标: 7824369-7826525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000969`
名称	SmilChr05G000969
描述	disease resistance RPP13-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7824369 - 7826525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025472`
GeneID	`131025472`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025472`
原始查询	`SmilChr05G000969`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP13-like protein 4
产物	disease resistance RPP13-like protein 4
Arabidopsis	`AT5G45500` (AT5G45500) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834586] identity=33.3; qcov=0.783; evalue=3.79e-87; confidence=low
Rice	`Os01g0799000` - identity=37.6; qcov=0.714; evalue=2.58e-102; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025472

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811251.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811251.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811251.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811251.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7824489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:7824569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B90,C21
`Chr5:7824756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C70,C83,C84
`Chr5:7824835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B80
`Chr5:7824855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,D4
`Chr5:7824955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:7825218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr5:7825448`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr5:7825448`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr5:7825474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:7825582`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr5:7825582`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811251.1

718 aa

359

718

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 217-275 aa PF23598 LRR_14 420-638 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811251.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	217	275	7.8e-07	29.8	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057811251.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	420	638	1.4e-20	74.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955268.1
ATGTCGCATAGCCCAAATTCAACTGAGCTGCCGGAGCAGAATGACAAGAAAGAGGAGAACAAACAAGTCCCCTCGAGACGGTCAAGGAATATTTGGAGGAGAGTAATGGGCAAAATGAGGGTAGCAGGGCTGATAAAGGCGAATCCGGCGCCCGCGAGCCCGGCACCCGCTAGCCCGTCCCTGAATCCGGCACCCGCGAGCCCGTCCCCGCCCTTGGATGCCGACTCAATGTTGCTTGTTAATTTGATCAATGGCGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025472
ATGTCGCATAGCCCAAATTCAACTGAGCTGCCGGAGCAGAATGACAAGAAAGAGGAGAACAAACAAGTCCCCTCGAGACGGTCAAGGAATATTTGGAGGAGAGTAATGGGCAAAATGAGGGTAGCAGGGCTGATAAAGGCGAATCCGGCGCCCGCGAGCCCGGCACCCGCTAGCCCGTCCCTGAATCCGGCACCCGCGAGCCCGTCCCCGCCCTTGGATGCCGACTCAATGTTGCTTGTTAATTTGATCAATGGCGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811251.1
MSHSPNSTELPEQNDKKEENKQVPSRRSRNIWRRVMGKMRVAGLIKANPAPASPAPASPSLNPAPASPSPPLDADSMLLVNLINGDLDRMSEEAKALTKYNTQLTLELETLKDIFKGIRTGEGDEKQRKAWLNTFRKELMKVKLAIPSKYDVRAEKNKHDNKSIKKLQQRICGEESKEIPQLHNAHLFKTSVELKDFEVRYNELELRVKLCLLCFSIFPQGATVKKRLMLQWWVVEGFASTVEAADGYFKELMEKGFIQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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