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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000974`

染色体: Chr05 坐标: 7878045-7879089 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000974`
名称	SmilChr05G000974
描述	transcription factor NIGTH1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7878045 - 7879089 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985687`
GeneID	`130985687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985687`
原始查询	`SmilChr05G000974`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor NIGTH1-like
产物	transcription factor NIGTH1-like
Arabidopsis	`AT2G03500` (AT2G03500) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814878] identity=62.4; qcov=0.463; evalue=1.98e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0176700` - identity=68.3; qcov=0.463; evalue=1.83e-37; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF26575 (HHO5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764757.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764757.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764757.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764757.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7878073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr5:7878101`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B131
`Chr5:7878101`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B131
`Chr5:7878287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B79,C3
`Chr5:7878447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C83
`Chr5:7878742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B90,B92,C21,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764757.1

239 aa

120

239

HHO5_N

PF26575 HHO5_N 20-65 aa

XP_057764758.1

218 aa

109

218

HHO5_N

Myb_DNA-binding

PF26575 HHO5_N 20-65 aa PF00249 Myb_DNA-binding 121-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764757.1`	Pfam	`PF26575`	HHO5_N	Domain	20	65	5.1e-21	75.2	HHO5-like, N-terminal domain
`XP_057764758.1`	Pfam	`PF26575`	HHO5_N	Domain	20	65	4.4e-21	75.4	HHO5-like, N-terminal domain
`XP_057764758.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	121	172	7.4e-07	29.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908774.1
ATGGCATCAACTGAACTCAGTCTTGATTGCAAGCCCAATATCGAATCTCTGGTTTTGAAAAAAACACAGAAGCTGGAAGAATTTGTAGCCCGTCTCGAAGAAGAAAAACTCAAGATTGACGCCTTCAAGCGTGAGCTTCCACTTTGCATGCAACTTCTCAGCAACGCTATGGAGGCGTCAAGGCAGGAGCTGCAGTCGCAGAGGATGAAGCAACTCTCAGCAGATAAAGCTAAGTGGATGTCATCTGCAACACTCTGGAA...

XM_057908775.1
ATGGCATCAACTGAACTCAGTCTTGATTGCAAGCCCAATATCGAATCTCTGGTTTTGAAAAAAACACAGAAGCTGGAAGAATTTGTAGCCCGTCTCGAAGAAGAAAAACTCAAGATTGACGCCTTCAAGCGTGAGCTTCCACTTTGCATGCAACTTCTCAGCAACGCTATGGAGGCGTCAAGGCAGGAGCTGCAGTCGCAGAGGATGAAGCAACTCTCAGCAGATAAAGCTAAGTGGATGTCATCTGCAACACTCTGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985687
ATGGCATCAACTGAACTCAGTCTTGATTGCAAGCCCAATATCGAATCTCTGGTTTTGAAAAAAACACAGAAGCTGGAAGAATTTGTAGCCCGTCTCGAAGAAGAAAAACTCAAGATTGACGCCTTCAAGCGTGAGCTTCCACTTTGCATGCAACTTCTCAGCAACGCTATGGAGGCGTCAAGGCAGGAGCTGCAGTCGCAGAGGATGAAGCAACTCTCAGCAGATAAAGCTAAGTGGATGTCATCTGCAACACTCTGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764757.1
MASTELSLDCKPNIESLVLKKTQKLEEFVARLEEEKLKIDAFKRELPLCMQLLSNAMEASRQELQSQRMKQLSADKAKWMSSATLWNHQVPPPELRLAPPEDSHVCTRENSGDHKEKRKARRCWSPQLHSRFLNALHMLGGLQLATPKQITQLMKVEGLTSDEVKSHLQVLSLPLINWSFKTNYEFVCPQKYRLHTGIQAPSPVVVVGGIWVPPEYAAHAGASPAAFYGATAPTILPPR

XP_057764758.1
MASTELSLDCKPNIESLVLKKTQKLEEFVARLEEEKLKIDAFKRELPLCMQLLSNAMEASRQELQSQRMKQLSADKAKWMSSATLWNHQVPPPELRLAPPEDSHVCTRENSGDHKEKRKARRCWSPQLHSRFLNALHMLGGLQLATPKQITQLMKVEGLTSDEVKSHLQKYRLHTGIQAPSPVVVVGGIWVPPEYAAHAGASPAAFYGATAPTILPPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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