当前解析结果
SmilChr05G000978| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000978 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000978 |
| 描述 | glutamate receptor 2.3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7898252 - 7898811 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985695 |
|---|---|
| GeneID | 130985695 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985695 |
| 原始查询 | SmilChr05G000978 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glutamate receptor 2.3-like |
| 产物 | glutamate receptor 2.3-like |
| Arabidopsis | AT2G29100 (GLR2.9)glutamate receptor 2.9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817458] identity=37.7; qcov=0.683; evalue=1.85e-10; confidence=low |
| Rice | Os09g0428600- identity=46.4; qcov=0.683; evalue=1.27e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985695 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057764766.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764766.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764766.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764766.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764766.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:7898314 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr5:7898344 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B4,B9,C4,C52 |
Chr5:7898587 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr5:7898644 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B31,B59,C1,C62 |
Chr5:7898668 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A20,A6,B12,B51,B65,B84,C41,C44,C63,C71 |
Chr5:7898673 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A20,A6,B12,B51,B65,B84,C41,C44,C63,C71 |
Chr5:7898680 |
T |
TTG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A20,A6,B12,B51,B65,B84,C41,C44,C63,C71 |
Chr5:7898682 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A20,A6,B12,B51,B65,B84,C41,C44,C63,C71 |
Chr5:7898687 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A20,A6,B12,B51,B65,B84,C41,C44,C63,C71 |
Chr5:7898709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr5:7898712 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A25,B127,C55 |
Chr5:7898715 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。