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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000985`

染色体: Chr05 坐标: 7976363-7977001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000985`
名称	SmilChr05G000985
描述	calcium-binding protein PBP1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7976363 - 7977001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985702`
GeneID	`130985702`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985702`
原始查询	`SmilChr05G000985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium-binding protein PBP1-like
产物	calcium-binding protein PBP1-like
Arabidopsis	`AT5G54490` (PBP1) pinoid-binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835537] identity=60.6; qcov=0.832; evalue=6.31e-33; confidence=medium
Rice	`Os01g0783700` - identity=60; qcov=0.973; evalue=1.03e-38; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985702

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764774.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764774.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764774.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764774.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7976544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B73
`Chr5:7976547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764774.1

113 aa

113

EF-hand_8

PF13833 EF-hand_8 44-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764774.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	44	95	1.9e-15	57.1	EF-hand domain pair

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908791.1
GTTGCATTCAACAGAATCCAATCTCAGCAGTACTTTCGAAATCGTCCGCATGTTTCCGCGAACGAAGTTTCCTTCTTCACACAATTTACGATGCCTCCACTTCTAATTACCATATCTATAAATCATGACCCATCTCACATTGCATTCATCTAAGATTATATAATATGGGAAAGAGAGAAGACGTTACTGGTGTGGTGTTTGAGGATCATTTTCCGGCGATGGTGGAGAAGCTGGGAGCGGAGGGGTTTATGAATGAGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985702
ATGGGAAAGAGAGAAGACGTTACTGGTGTGGTGTTTGAGGATCATTTTCCGGCGATGGTGGAGAAGCTGGGAGCGGAGGGGTTTATGAATGAGCTGTGTAAAGGGTTTGAGGTGCTCATGGATTCTCACAAACAGCTCATCACATTCCACAGCCTGAAGAAGAATGCTGTCGTCTTGGGTTTGCAGGTCGACGATGATGATATGCTCCGGTGTATGTTGAAGGAAGGTGATTTGGACGGCGATGGGTGTCTCGATCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764774.1
MGKREDVTGVVFEDHFPAMVEKLGAEGFMNELCKGFEVLMDSHKQLITFHSLKKNAVVLGLQVDDDDMLRCMLKEGDLDGDGCLDQMEFCVLMFRLSPNLMNRATDILFQDVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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