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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001019`

染色体: Chr05 坐标: 8356817-8358799 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001019`
名称	SmilChr05G001019
描述	uncharacterized SmilChr05G001019
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8356817 - 8358799 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025477`
GeneID	`131025477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025477`
原始查询	`SmilChr05G001019`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=23.3; qcov=0.839; evalue=7.41e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811255.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811255.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811255.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811255.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8357240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B30,C35,C7,C75
`Chr5:8357244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B59,C33
`Chr5:8357252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C35
`Chr5:8357261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr5:8357267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:8357289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A6,B57,C33
`Chr5:8357302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B67,D10
`Chr5:8357304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B101
`Chr5:8357304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:8357309`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A24,B103,B123,B128,B18,B35,B64,B78,B81,B85,C1,C24,C31,C37,C49,C55,C82
`Chr5:8357312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B53,C48,D8
`Chr5:8357312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C48,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811255.1

286 aa

143

286

DUF1985

PF09331 DUF1985 102-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811255.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	102	227	1.4e-11	45.2	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955272.1
ATGAGCGAAACGGATTCCGACCATCCCCATGATGAGGAAACACAACCTCCATTACTTCCACCGGCACCTTATAGGTGGAAGAGACCGTCTTTGATTTATGAAACTCGTGCTATTAATCTCTATGTACGGAACACTATATTTGAAGAGATACGAACCACATTGAAGGCTGTTGGTGGCAAATCTACTATTCAAACATTCAAAAGTGGAACAATTGGGCGTCTTAGTGATCACGAGAGATACGCTAGCGCCAACAATGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025477
ATGAGCGAAACGGATTCCGACCATCCCCATGATGAGGAAACACAACCTCCATTACTTCCACCGGCACCTTATAGGTGGAAGAGACCGTCTTTGATTTATGAAACTCGTGCTATTAATCTCTATGTACGGAACACTATATTTGAAGAGATACGAACCACATTGAAGGCTGTTGGTGGCAAATCTACTATTCAAACATTCAAAAGTGGAACAATTGGGCGTCTTAGTGATCACGAGAGATACGCTAGCGCCAACAATGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811255.1
MSETDSDHPHDEETQPPLLPPAPYRWKRPSLIYETRAINLYVRNTIFEEIRTTLKAVGGKSTIQTFKSGTIGRLSDHERYASANNVLHHLLSRQIEGGDIPPHEAWFVVGSRIIRFTAPDYALITGLHFGFCEFDPDAEHQIPANSIFYRYFGGRPTKVGTLKTKFKAKQLGKDPEDYIKAGNLLMYYLFLLCRDDVYIEAWAWTLVEDLDEWNWFPWGSYTYQVLLHYLSLAGTRDDVLKKPAYHFFGPVWALQIWSYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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