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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001023`

染色体: Chr05 坐标: 8393853-8394392 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001023`
名称	SmilChr05G001023
描述	uncharacterized SmilChr05G001023
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8393853 - 8394392 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025478`
GeneID	`131025478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025478`
原始查询	`SmilChr05G001023`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821606]; symbol=AT3G20590; hit=AT3G20590; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821606]; symbol=AT3G20590; hit=AT3G20590; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G20590` (AT3G20590) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821606] identity=26.2; qcov=1.02; evalue=4e-07; confidence=low
Rice	`Os07g0531500` (P0681F05.132) - identity=26.9; qcov=0.933; evalue=1.63e-06; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057811256.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057811256.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057811256.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811256.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8393872`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C26
`Chr5:8393872`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C26
`Chr5:8393944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr5:8393969`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr5:8393969`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr5:8394141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C28,C8
`Chr5:8394176`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr5:8394176`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr5:8394273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811256.1

179 aa

179

LEA_2

PF03168 LEA_2 63-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811256.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	63	138	5.2e-08	34.0	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955273.1
ATGGCTTGGCGAAGAGTGGATCAGGATCGACTAGTGATCTACTACTGGTTCTTTTGTGAGGTGACTGTGGTGAGTTTGGTTGGAGTGGCTCTATGGCTCAGCCTCACTCCAAGAAATCCGCGTTTCACTATTTCAGCCGCTCATTTTCCACAGCTCAATCATACTACCTCTCTAGTGATCTGCATGAAAATCTTCAATCCCAACAATCATATGGGGATAGATTATAGCGGCATAAGCTTCAAGCTGTACGCCGCCGGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025478
ATGGCTTGGCGAAGAGTGGATCAGGATCGACTAGTGATCTACTACTGGTTCTTTTGTGAGGTGACTGTGGTGAGTTTGGTTGGAGTGGCTCTATGGCTCAGCCTCACTCCAAGAAATCCGCGTTTCACTATTTCAGCCGCTCATTTTCCACAGCTCAATCATACTACCTCTCTAGTGATCTGCATGAAAATCTTCAATCCCAACAATCATATGGGGATAGATTATAGCGGCATAAGCTTCAAGCTGTACGCCGCCGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811256.1
MAWRRVDQDRLVIYYWFFCEVTVVSLVGVALWLSLTPRNPRFTISAAHFPQLNHTTSLVICMKIFNPNNHMGIDYSGISFKLYAAGGVIAANSTPGFRQGYKNITLFHMPIQTTQELWNASSDVDFMLSLETAFRFRIIKWRTKIRHIVRQQRFSINLNGSASGSCMELQNAHIVKTRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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