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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001029`

染色体: Chr05 坐标: 8445051-8448787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001029`
名称	SmilChr05G001029
描述	chaperone protein dnaJ 50
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8445051 - 8448787 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985761`
GeneID	`130985761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985761`
原始查询	`SmilChr05G001029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 50
产物	chaperone protein dnaJ 50
Arabidopsis	`AT1G61770` (AT1G61770) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842474] identity=69.3; qcov=1; evalue=6.18e-150; confidence=high
Rice	`Os12g0258200` (OsDjC79) - identity=70.3; qcov=0.92; evalue=3.72e-149; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057764861.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057764861.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764861.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764861.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8445223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B94
`Chr5:8445293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:8445450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:8445615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B140,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764861.1

309 aa

154

309

DnaJ

PF00226 DnaJ 34-95 aa

XP_057764862.1

300 aa

150

300

DnaJ

PF00226 DnaJ 34-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764861.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	34	95	5.1e-24	84.9	DnaJ domain
`XP_057764862.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	34	95	4.7e-24	85.0	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908879.1
GATGCAAATATTCCGGTGAAATATAATGGAGGGAGAGAGAGAGATTTATTAAGGAGGATATAATCGTACTTTCACTTTGTGGAAGGTATGCGCCAGTAACAAATTCCCAGTTCTGGGCGCAGATCCTTCTCCGAGTCAAAACGGCGGCTAATGGAGCCGTTAGCTTCTATCCGCTGGAGCTTTTCCACATTAATCTTCCTGGTCTTCCTCCTCATTCAACCATCTCTTTCGATCTACTGCGACGAGGATGATTGCTACGA...

XM_057908878.1
AGGGAGAGAGAGAGATTTATTAAGGAGGATATAATCGTACTTTCACTTTGTGGAAGGTATGCGCCAGTAACAAATTCCCAGTTCTGGGCGCAGATCCTTCTCCGAGTCAAAACGGCGGCTAATGGAGCCGTTAGCTTCTATCCGCTGGAGCTTTTCCACATTAATCTTCCTGGTCTTCCTCCTCATTCAACCATCTCTTTCGATCTACTGCGACGAGGATGATTGCTACGATCTTTTAGGGGTCACTCAGAGTGCCAATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985761
ATGGAGCCGTTAGCTTCTATCCGCTGGAGCTTTTCCACATTAATCTTCCTGGTCTTCCTCCTCATTCAACCATCTCTTTCGATCTACTGCGACGAGGATGATTGCTACGATCTTTTAGGGGTCACTCAGAGTGCCAATGCCTCCGAGATCAAGAAAGCTTACTACAAGCTCTCTCTTAAACATCATCCGGATAAAAATCCGGATCCCGAATCGAAAAAGTTTTTTGTGAAGATTGCAAATGCTTACGAGATATTGAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764861.1
MEPLASIRWSFSTLIFLVFLLIQPSLSIYCDEDDCYDLLGVTQSANASEIKKAYYKLSLKHHPDKNPDPESKKFFVKIANAYEILKDEATREQYDYAIAHPEEVFYNTARYYHAYYGHKTDTRAVLVGLLLILSGFQYLNQWTRYNQAIDMVKKTPAYKNKLKAMELERTGGVTNRKKGNKQINKYDLPYIDSMQMVEDLSKELELQIKGAEKPSLWELLAIRVILLPYTVGKLLLWYGHWLWRYQVKRERYSWEDASYL...

XP_057764862.1
MEPLASIRWSFSTLIFLVFLLIQPSLSIYCDEDDCYDLLGVTQSANASEIKKAYYKLSLKHHPDKNPDPESKKFFVKIANAYEILKDEATREQYDYAIAHPEEVFYNTARYYHAYYGHKTDTRAVLVGLLLILSGFQYLNQWTRYNQAIDMVKKTPAYKNKLKAMELERTGGVTNRKKGNKQINKQMVEDLSKELELQIKGAEKPSLWELLAIRVILLPYTVGKLLLWYGHWLWRYQVKRERYSWEDASYLTRRSLGVPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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