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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001049`

染色体: Chr05 坐标: 8691529-8692884 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001049`
名称	SmilChr05G001049
描述	uncharacterized SmilChr05G001049
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8691529 - 8692884 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025482`
GeneID	`131025482`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025482`
原始查询	`SmilChr05G001049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27; qcov=0.514; evalue=6.29e-11; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=36.3; qcov=0.319; evalue=5.4e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025482

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811260.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811260.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811260.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811260.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8691553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B139,B32,C45
`Chr5:8691559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B139,B32,C45
`Chr5:8691579`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	109	A10,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A5,A6,A8,A9,B10,B105,B106,B11,B114,B117,B12,B120,B122,B127,B129,B13,B131,B132,B136,B138,B14,B140,B15,B16,B2,B20,B21,B23,B26,B27,B29,B3,B30,B32,B34,B36,B40,B46,B47,B51,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B62,B67,B68,B72,B73,B75,B78,B82,B83,B84,B94,B95,B96,C11,C12,C14,C15,C18,C22,C23,C24,C26,C31,C32,C35,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C48,C49,C52,C54,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C68,C75,C78,C8,C80,C81,C82,D11,D4,D5,D7,D8
`Chr5:8691583`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	108	A10,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A5,A6,A8,A9,B10,B105,B106,B11,B114,B117,B12,B120,B122,B127,B129,B13,B131,B132,B136,B138,B14,B140,B15,B16,B2,B20,B21,B23,B26,B27,B29,B3,B32,B34,B36,B40,B46,B47,B51,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B62,B67,B68,B72,B73,B75,B78,B82,B83,B84,B94,B95,B96,C11,C12,C14,C15,C18,C22,C23,C24,C26,C31,C32,C35,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C48,C49,C52,C54,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C68,C75,C78,C8,C80,C81,C82,D11,D4,D5,D7,D8
`Chr5:8691593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr5:8691608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	105	A10,A14,A16,A18,A2,A21,A22,A5,A6,A8,A9,B10,B105,B106,B11,B114,B117,B12,B120,B122,B127,B129,B131,B132,B136,B138,B140,B15,B16,B2,B20,B21,B23,B27,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B40,B46,B47,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B62,B65,B67,B68,B72,B73,B75,B76,B82,B83,B84,B88,B94,B95,B96,C11,C12,C14,C15,C18,C22,C23,C24,C26,C31,C32,C35,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C48,C49,C52,C54,C57,C59,C6,C61,C62,C64,C66,C68,C74,C75,C78,C80,C82,D11,D4,D5
`Chr5:8691637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C35
`Chr5:8691655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A18,C56
`Chr5:8691655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C56
`Chr5:8691663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:8691673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:8691675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811260.1

389 aa

194

389

RVT_1

PF00078 RVT_1 266-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811260.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	266	378	1.2e-17	65.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955277.1
ATGAAACCCCACACAACCGACCTCCAACCAACACACTCCATGCTGGAAAAAAGGCCGAAGAAGCACCCCAAGATGTCAAGCAACAACACACTATCTGAAGAAGCACTCCAAAGAACGGTCTCGGATCACTGCCCGTTAATGATGGAAACAATCACTGTTGATTGGGGGCCGAAGCCATTTAGATTCATAAATGCCTGGACAAGCCACCCAGATTTTGAAAAGGTGGTCAAAGATTCGTGGCAAAGACCCGGCATCTCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025482
ATGAAACCCCACACAACCGACCTCCAACCAACACACTCCATGCTGGAAAAAAGGCCGAAGAAGCACCCCAAGATGTCAAGCAACAACACACTATCTGAAGAAGCACTCCAAAGAACGGTCTCGGATCACTGCCCGTTAATGATGGAAACAATCACTGTTGATTGGGGGCCGAAGCCATTTAGATTCATAAATGCCTGGACAAGCCACCCAGATTTTGAAAAGGTGGTCAAAGATTCGTGGCAAAGACCCGGCATCTCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811260.1
MKPHTTDLQPTHSMLEKRPKKHPKMSSNNTLSEEALQRTVSDHCPLMMETITVDWGPKPFRFINAWTSHPDFEKVVKDSWQRPGISGWSCYIFKEKMKRLKVDLKAWNKSCFGSIDESIEKLKDELKEWDTKDDNVGLDEEEVLKRNETSASLILQMKNRDSLLAQKAKIRWLQDGDINSGYYHKVINGRRAKNDLPGLQIKGRWIDDPAEVKKEIRDHFEAQFRQISGLQPVIPADFAQNKITADMSQQLDAQFTEEEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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