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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001050`

染色体: Chr05 坐标: 8700247-8716005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001050`
名称	SmilChr05G001050
描述	tryptophan synthase beta chain 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8700247 - 8716005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985750`
GeneID	`130985750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985750`
原始查询	`SmilChr05G001050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tryptophan synthase beta chain 1-like
产物	tryptophan synthase beta chain 1-like
Arabidopsis	`AT5G28237` (AT5G28237) Pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2746023] identity=70.4; qcov=0.817; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0135900` (TS) - identity=62.2; qcov=0.817; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000162 (L-tryptophan biosynthetic process); GO:0004834 (tryptophan synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00291 (PALP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764841.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057764841.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057764841.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764841.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8700431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:8700681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:8701315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:8701456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:8701506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B99
`Chr5:8701641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:8701711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:8701837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:8702420`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B26,B4,B43,B59,B89,C30,C52,C60,D9
`Chr5:8715735`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B44,B89
`Chr5:8715735`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B44,B89
`Chr5:8715738`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764841.1

476 aa

238

476

PALP

PF00291 PALP 124-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764841.1`	Pfam	`PF00291`	PALP	Family	124	450	1.1e-45	156.9	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908858.1
ATTAAAAGCCCAGACCCACGAAACCACTATACTATAAAATTCGACAGCCAGCTGAATTTACCTAGTAATTCTTGGCTCTCTCTTTTCTCATTAGAAAGTAGTAAAACCATGAATCTTCAAACTCTATCTCTTCACTACGCCATCTCTCTTTCCCCCCTGAATCCTAATAATTCAACTAGACTCAGTTTGAAATGGTCATCGCGAATGGTTGAACACAAAGCTTTCAAGGTAAGCTCAGTAGTGATGAGACACGATACATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985750
ATGAATCTTCAAACTCTATCTCTTCACTACGCCATCTCTCTTTCCCCCCTGAATCCTAATAATTCAACTAGACTCAGTTTGAAATGGTCATCGCGAATGGTTGAACACAAAGCTTTCAAGGTAAGCTCAGTAGTGATGAGACACGATACATGCAGTACTCAAACTCAAACTCAGAAGACAGACCTTCTCCAACTCATTGATGAAACGGAAGAATCGTTGTTTAGGACAGGCAAATACGGCAGGTTTGGAGGAATCTTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764841.1
MNLQTLSLHYAISLSPLNPNNSTRLSLKWSSRMVEHKAFKVSSVVMRHDTCSTQTQTQKTDLLQLIDETEESLFRTGKYGRFGGIFVPETLVTCLNMLASEFNLCLHDPHFQGELATALRDYVGRETPLYLAQRLSDHYKNSRGEGPDIYLKREDLNHGGAHKINNAIAQAMLAKRMGRQSVVSATGAGQHGVATAAACAKLDMECTIFMGDVDMAKQSSNVRLMKHLGARVKSVQGTFKDATSEAIRQWVGDLERKYYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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