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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001069`

染色体: Chr05 坐标: 8824528-8827292 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001069`
名称	SmilChr05G001069
描述	UPF0051 protein ABCI8, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8824528 - 8827292 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985748`
GeneID	`130985748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985748`
原始查询	`SmilChr05G001069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0051 protein ABCI8, chloroplastic
产物	UPF0051 protein ABCI8%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G04770` (ABCI8) ATP binding cassette protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825814] identity=78.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0830000` (OsABCI5) - identity=75.2; qcov=0.867; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly)
KEGG	-
Pfam	PF01458 (SUFBD_core); PF19295 (SufBD_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764839.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764839.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764839.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764839.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8824750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:8824809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:8824810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:8824823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C43
`Chr5:8824927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D6
`Chr5:8824980`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A10,B136,B33,B36,B4,B49,B55,B72,B79,B81,C17,C42,C78,D8
`Chr5:8825305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:8825643`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B10
`Chr5:8825643`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B10
`Chr5:8825674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:8825698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C60,C73,D6
`Chr5:8825752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764839.1

549 aa

274

549

SufBD_N

SUFBD_core

PF19295 SufBD_N 205-272 aa PF01458 SUFBD_core 278-520 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764839.1`	Pfam	`PF19295`	SufBD_N	Family	205	272	1.1e-12	48.7	SufBD protein N-terminal region
`XP_057764839.1`	Pfam	`PF01458`	SUFBD_core	Domain	278	520	2.2e-76	257.1	SUF system FeS cluster assembly, SufBD core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908856.1
TGGTGAGCATACGACATTAAGGAAAATCTCAACGAGTAGTGGCCACATAAACATAAATCGAATTCATTCCAGAAATTTATGAAAGTCGGCTATAGCTGCTGAATTGCGACAAACAAAATTCGCAGTCAAATATTTCCATCTTCATCTTCAACTTGTGTCTCCTCAACAATCTGCACCACCACAATCCGACCGCATGGCCTCGCTTCTCACCAACGGGATTTCGCCCTTTTCGTCGCAGCACGTTTCCGAATTCCCAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985748
ATGGCCTCGCTTCTCACCAACGGGATTTCGCCCTTTTCGTCGCAGCACGTTTCCGAATTCCCAAAGGGCCCTCTTCTGCACTCAATCCCCAAATCCCCAATTCTCAGAATCCCTAATTCAAGAACTTCCTTCAAGATTAGGGCTGATGTCGGATATGAGCCCAAGACCAGCGTCGATTCTCCAGGTAAGAAATCCTTGGACTCATCGTCCAACGGCGATGACCCACTTCAAAAATTCTTGAAAAGAGATTATAAGTGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764839.1
MASLLTNGISPFSSQHVSEFPKGPLLHSIPKSPILRIPNSRTSFKIRADVGYEPKTSVDSPGKKSLDSSSNGDDPLQKFLKRDYKWGFTQEIDSFTIPKGLSEETVRLISSRKKEPDWMLEFRLKSYEKFVKMKEPSWSDNQYPKMNFQDICYYSEPKKKPTLNSLDEADPELVMYFEKLGIPLNERNRLANVAVDAVLDSVSIATTHRKTLEKSGVIFCSISEAIREYPDLIRQYLGRVVPADDNFYAALNSAVFSDGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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