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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001083`

染色体: Chr05 坐标: 8999724-9001318 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001083`
名称	SmilChr05G001083
描述	ATP synthase gamma chain, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8999724 - 9001318 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985789`
GeneID	`130985789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985789`
原始查询	`SmilChr05G001083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase gamma chain, chloroplastic
产物	ATP synthase gamma chain%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G04640` (ATPC1) ATPase, F1 complex, gamma subunit protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825797] identity=82.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0513000` (P0580A11.134) - identity=71.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000275 (GO:0000275); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00231 (ATP-synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764892.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057764892.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057764892.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057764892.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9000118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:9000160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B79
`Chr5:9000417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr5:9000424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:9000442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B73,B75,C57,C85,D3
`Chr5:9000701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr5:9000709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr5:9000829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:9000961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B73,B75,C57,C85,D3
`Chr5:9000962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:9000985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C67,D10
`Chr5:9001065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764892.1

365 aa

182

365

ATP-synt

PF00231 ATP-synt 44-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764892.1`	Pfam	`PF00231`	ATP-synt	Domain	44	364	4.4e-91	306.2	ATP synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908909.1
CTCTCATAAAAGAAATGACAATGGCAAAAAATACAAAAATATTGCACACTGATTGTGCCAAAGTATATTCCTCGGCAGGCAATCGGTATTTACATTTTAGAAACGAAACGTATAGAAAAAATAATCAAGAGATTTGTTGGTGCCCACATATAGTGTATATTTTGTAAAATCCTTATCCTAAAACCTGATCCTATTGCTCTCCCTCCGCCTCTCATTTCAATGGACGCACCTCCACTAACAAAATCCACCCACACAAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985789
ATGTCTTGCTCGAATCTGACAATGCCTTCCCTGTCGGAGCTCTCCTCTCGCTCTTTCATCGCTCCTTTCCAGCTCCCAAGCTCCAACTCCAGCTCTCCATGCAGATCCTCCACCACCCAAATCCAGTGCAGTCTCCGCGATCTCCGCGACCGCATCGCCTCCGTGACCAACACGCAGAAGATCACGGAGGCCATGAAGCTGGTGGCCGCCGCCAAGGTGAGGAGAGCGCAGGAGGCCGTGGTGAACGCCCGGCCCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764892.1
MSCSNLTMPSLSELSSRSFIAPFQLPSSNSSSPCRSSTTQIQCSLRDLRDRIASVTNTQKITEAMKLVAAAKVRRAQEAVVNARPFSETLVEVLYNINEQLLTDDIDVPLTKVRPVKKVALVVVTGDRGLCGGFNNYIIKKADARIKELTALGLDYVVISVGKKGNSYFLRRPYIPVDKFIEGTNLPTAKEAQAIADDVFSLFVSEEVDKVELLYTKFVSLVKSNPVIHTLLPLSPKGEICDINGICVDAAEDEFFRLTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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