Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001084`

染色体: Chr05 坐标: 9021228-9024221 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001084`
名称	SmilChr05G001084
描述	pescadillo homolog
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9021228 - 9024221 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985790`
GeneID	`130985790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985790`
原始查询	`SmilChr05G001084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pescadillo homolog
产物	pescadillo homolog
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985790

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764893.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057764893.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057764893.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057764893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9023557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:9023620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:9023622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:9023628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B100,B2,C16,C45
`Chr5:9023641`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C16
`Chr5:9023641`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C16
`Chr5:9023700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B100,B104,B2,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908910.1
CCAATAGCACATGCTTTCATTTGGCGCCTCTGAAGATTTTGGGTCGATTATCATAAGGTTACACATTGGCTGCGTCCCTCCACAGGTACTATGAAGGTGTTGTGAAGTCATTTGATACCGAAAAGAACAAGCATGTGATATTATACGACGATGGGGACGTGGAAGTTCTTCGATTAGATAGGGAGCGCTGGGACCTTGTTAACAATGGTCTAAAGGCCAAGCGTTCTGGTTCATCAAGGGGCTTTTCTCCTAAAGGAGGA...

XM_057908911.1
CCAATAGCACATGCTTTCATTTGGCGCCTCTGAAGATTTTGGGTCGATTATCATAAGGTTACACATTGGCTGCGTCCCTCCACAGGTACTATGAAGGTGTTGTGAAGTCATTTGATACCGAAAAGAACAAGCATGTGATATTATACGACGATGGGGACGTGGAAGTTCTTCGATTAGATAGGGAGCGCTGGGACCTTGTTAACAATGGTCTAAAGGCCAAGCGTTCTGGTTCATCAAGGGGCTTTTCTCCTAAAGGAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057764893.1_26436
ATGTTGAATAGTGAGACCTTGGAGGAAAGTGATGAAACACCAGGTGTTGCTTCTCCTGAAATTTCCATCAAGTCACCAACTAATGATTCTTGCTCAGATGATGAACCAACTGAAACAAGTGGTAAGGCTTTAGATGCAAAGGATTCATCTAACGACGATGACGAAGATAAGCATCAAGAAGATGTTGAGAACTTCTCGAGTGATGATGAAGAGGCCAAAGAGACAGAAAAAGATTCTGAAGGCACTGAGATTGATAATCT...

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057764894.1_26437
ATGTTGAATAGTGAGACCTTGGAGGAAAGTGATGAAACACCAGGTGTTGCTTCTCCTGAAATTTCCATCAAGTCACCAACTAATGATTCTTGCTCAGATGATGAACCAACTGAAACAAGTGGTAAGGCTTTAGATGCAAAGGATTCATCTAACGACGATGACGAAGATAAGCATCAAGAAGATGTTGAGAACTTCTCGAGTGATGATGAAGAGGCCAAAGAGACAGAAAAAGATTCTGAAGGCACTGAGATTGATAATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764893.1
MLNSETLEESDETPGVASPEISIKSPTNDSCSDDEPTETSGKALDAKDSSNDDDEDKHQEDVENFSSDDEEAKETEKDSEGTEIDNLGGPSRDSHGSDDEAVSSSDKQQPSEAAEVSGEEADEADCTDRHAKPSKKLNKKATSHSVHVDLSDDEPLFLWKQRSKRK

XP_057764894.1
MLNSETLEESDETPGVASPEISIKSPTNDSCSDDEPTETSGKALDAKDSSNDDDEDKHQEDVENFSSDDEEAKETEKDSEGTEIDNLGGPSRDSHGSDDEAVSSSDKQQPSEAAEVSGEEADEADCTDRHAKPSKKLNKKATSHSVHVDLSDDEPLFLWKQRSKRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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