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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001089`

染色体: Chr05 坐标: 9083686-9086490 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001089`
名称	SmilChr05G001089
描述	autophagy-related protein 8C-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9083686 - 9086490 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985796`
GeneID	`130985796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985796`
原始查询	`SmilChr05G001089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 8C-like
产物	autophagy-related protein 8C-like
Arabidopsis	`AT1G62040` (ATG8C) Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842499] identity=88.1; qcov=0.967; evalue=2.29e-75; confidence=high
Rice	`Os08g0191600` (OsATG8c) - identity=89.1; qcov=0.975; evalue=1.14e-76; confidence=high
GO	GO:0006995 (cellular response to nitrogen starvation)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02991 (ATG8); PF04110 (APG12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057764898.1`
2	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.80000	`XP_057764898.1`
3	Autophagosome	Autophagosome	0.80000	`XP_057764898.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057764899.1`
5	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057764899.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9084279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:9085108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:9086080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764898.1

140 aa

140

ATG8

APG12

PF02991 ATG8 32-135 aa PF04110 APG12 58-135 aa

XP_057764899.1

122 aa

122

ATG8

APG12

PF02991 ATG8 14-117 aa PF04110 APG12 40-117 aa

XP_057764900.1

122 aa

122

ATG8

APG12

PF02991 ATG8 14-117 aa PF04110 APG12 40-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764898.1`	Pfam	`PF02991`	ATG8	Domain	32	135	2.2e-50	169.9	Autophagy protein Atg8 ubiquitin like
`XP_057764898.1`	Pfam	`PF04110`	APG12	Domain	58	135	4.8e-06	27.6	Ubiquitin-like autophagy protein Apg12
`XP_057764899.1`	Pfam	`PF02991`	ATG8	Domain	14	117	1.4e-50	170.5	Autophagy protein Atg8 ubiquitin like
`XP_057764899.1`	Pfam	`PF04110`	APG12	Domain	40	117	3.5e-06	28.1	Ubiquitin-like autophagy protein Apg12
`XP_057764900.1`	Pfam	`PF02991`	ATG8	Domain	14	117	1.4e-50	170.5	Autophagy protein Atg8 ubiquitin like
`XP_057764900.1`	Pfam	`PF04110`	APG12	Domain	40	117	3.5e-06	28.1	Ubiquitin-like autophagy protein Apg12

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908916.1
AAAAAATTATTGTATATTAGTATGAAACAAGAATGAAATATTTTGAGAAAAATCAAATATGCTCCGCAGCCATGTTATTATTATTATTATTATTATATTATTATTATTATGAAAAATTACAAGAAAATGTTTAAGAATGAAAAAAAAAATCAGAATGCCAGAATTTATTAATTTTAGACCAAATTAACACTTAAAAAATTTGAGGTAATTTGTCAATCAAGATACCAATTACGTGTACGAATGAGACACCTCATTTCGTT...

XM_057908917.1
TCATATGTTTTATCCCCCTACCTTGTTTGGAACGTCCCAAATTATATTCAGTCACCCTTCAAGCTTCAATTTACTGCGCTTTGTTTCGTCTTTAGTAAGTTTCCGACCACACGTCTGCTTGAATTTGTGTGTTTAGTTGCTCTCTCCACGCAAAATTGGAGATCAAACATCGAATCTTCTGATGGCGAAGAGTTCTTTCAAACTGGAGCACCCTTTGGAGAAAAGACAGGCAGAATCCGCTCGCATCAGAGAGAAATATC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985796
ATGTTGTTTCGATGTCTGAAATTCGCAGTTGGAGATCAAACATCGAATCTTCTGATGGCGAAGAGTTCTTTCAAACTGGAGCACCCTTTGGAGAAAAGACAGGCAGAATCCGCTCGCATCAGAGAGAAATATCCGGATAGAATTCCAGTCATCGTGGAGAAGGCAGAAAGAAGTGATGTTCCTGACATTGATAAAAAGAAATATCTCGTTCCTGCTGACCTGACCGTGGGGCAGTTTGTTTATGTGGTTCGGAAGAGGAT...

LOC130985796
ATGGCGAAGAGTTCTTTCAAACTGGAGCACCCTTTGGAGAAAAGACAGGCAGAATCCGCTCGCATCAGAGAGAAATATCCGGATAGAATTCCAGTCATCGTGGAGAAGGCAGAAAGAAGTGATGTTCCTGACATTGATAAAAAGAAATATCTCGTTCCTGCTGACCTGACCGTGGGGCAGTTTGTTTATGTGGTTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCTGAGAAAGCTATCTTTATCTTTGTCAAGGACGTGCTACCTCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764898.1
MLFRCLKFAVGDQTSNLLMAKSSFKLEHPLEKRQAESARIREKYPDRIPVIVEKAERSDVPDIDKKKYLVPADLTVGQFVYVVRKRIKLSAEKAIFIFVKDVLPPTASLLSAIYDEYKDEDGFLYMTYSGENTFGFYEGQ

XP_057764899.1
MAKSSFKLEHPLEKRQAESARIREKYPDRIPVIVEKAERSDVPDIDKKKYLVPADLTVGQFVYVVRKRIKLSAEKAIFIFVKDVLPPTASLLSAIYDEYKDEDGFLYMTYSGENTFGFYEGQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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