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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001091`

染色体: Chr05 坐标: 9094467-9096901 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001091`
名称	SmilChr05G001091
描述	protein RRC1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9094467 - 9096901 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985797`
GeneID	`130985797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985797`
原始查询	`SmilChr05G001091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RRC1-like
产物	protein RRC1-like
Arabidopsis	`AT5G25060` (RRC1) RNA recognition motif (RRM)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832577] identity=77.5; qcov=0.645; evalue=4.97e-31; confidence=medium
Rice	`Os02g0179900` - identity=78.9; qcov=0.645; evalue=2.25e-24; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764901.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764901.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057764902.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057764902.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9095395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:9095420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B125,B50,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764901.1

123 aa

123

RRM_1

PF00076 RRM_1 33-92 aa

XP_057764902.1

110 aa

110

RRM_1

PF00076 RRM_1 19-79 aa

XP_057764903.1

110 aa

110

RRM_1

PF00076 RRM_1 19-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764901.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	33	92	2.6e-09	37.5	RNA recognition motif
`XP_057764902.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	19	79	2e-09	37.9	RNA recognition motif
`XP_057764903.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	19	79	2e-09	37.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908920.1
CTTCGCAACGCCATCGTCTCACCCACCGTCGCACCGCCACCGAAGTCTGCTGCCTCCGGTGCTTTGTCCTTGGCCTCGGCCGACGAATGTAGCAGTCAATGTCGCGCATCTCTCCCATCGTCCTTCTCGGTCTTCCCCACCCCCAAATCCTAAACCCTAGGTTGTCGCAGGCGGCCTGCCATCGAAGCTTCTTAGGAAAGCCAACTTTCCCCTCACGACCTATCTCGCACTCCTCTATTTTTCCCCCAAATCCAGAACCC...

XM_057908918.1
CTTCGCAACGCCATCGTCTCACCCACCGTCGCACCGCCACCGAAGTCTGCTGCCTCCGGTGCTTTGTCCTTGGCCTCGGCCGACGAATGTAGCAGTCAATGTCGCGCATCTCTCCCATCGTCCTTCTCGGTCTTCCCCACCCCCAAATCCTAAACCCTAGGTTGTCGCAGGCGGCCTGCCATCGAAGCTTCTTAGGAAAGCCAACTTTCCCCTCACGACCTATCTCGCACTCCTCTATTTTTCCCCCAAATCCAGAACCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985797
ATGCTCATTTGTTATACCAGCAACAAATTCCCTACCTGGATGCCCGAGCTTCGTCGTTTCGCTCCCAATGTTCCAATCGTGCTAGTTGGAACAAAGTTAGATAAGATTGTTGATGAGAATTTCCTTTTGCGGACATTTGGAAGATTCGGTCCTATTGCCAGTGTAAACATCATGTGGCCGAGGACAGAAGAAGAACGGAGACGGCAAAGGAATTGTGGATTTGTGGCTTTCATGAATAGAGCTGATGCTCAAGCTGCAAA...

LOC130985797
ATGCCCGAGCTTCGTCGTTTCGCTCCCAATGTTCCAATCGTGCTAGTTGGAACAAAGTTAGATAAGATTGTTGATGAGAATTTCCTTTTGCGGACATTTGGAAGATTCGGTCCTATTGCCAGTGTAAACATCATGTGGCCGAGGACAGAAGAAGAACGGAGACGGCAAAGGAATTGTGGATTTGTGGCTTTCATGAATAGAGCTGATGCTCAAGCTGCAAAGGATGAAATGCAAGGGGGCAACTGTCATTTTATCCGGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764901.1
MLICYTSNKFPTWMPELRRFAPNVPIVLVGTKLDKIVDENFLLRTFGRFGPIASVNIMWPRTEEERRRQRNCGFVAFMNRADAQAAKDEMQGGNCHFIRSFWSPSNCCSKPKLRIGMPLGLLQ

XP_057764902.1
MPELRRFAPNVPIVLVGTKLDKIVDENFLLRTFGRFGPIASVNIMWPRTEEERRRQRNCGFVAFMNRADAQAAKDEMQGGNCHFIRSFWSPSNCCSKPKLRIGMPLGLLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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