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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001099`

染色体: Chr05 坐标: 9152785-9157046 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001099`
名称	SmilChr05G001099
描述	L-ascorbate oxidase homolog
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9152785 - 9157046 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985806`
GeneID	`130985806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985806`
原始查询	`SmilChr05G001099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase homolog
产物	L-ascorbate oxidase homolog
Arabidopsis	`AT4G22010` (sks4) SKU5 similar 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828290] identity=72.5; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0678800` - identity=71.5; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057764924.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764924.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764924.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764924.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764924.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9153387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:9154411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:9154459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D6
`Chr5:9155089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:9155163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C25,C53,C87
`Chr5:9155407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:9155660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764924.1

545 aa

272

545

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 36-149 aa PF00394 Cu-oxidase 162-298 aa PF07731 Cu-oxidase_2 380-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764924.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	36	149	1.5e-38	132.2	Multicopper oxidase
`XP_057764924.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	162	298	8.9e-42	143.6	Multicopper oxidase
`XP_057764924.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	380	518	3.2e-33	115.1	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908941.1
GCTACTAAAAGAAAAGGTGTCATAGCATTAACCGGGTAGGGGCAGCAGCAGGAGCAGCACGTGAGAGGGGCAAACCCGTCATTTTCACCCATACTACAGCACGCAGACGAAATGCTCATTTAGACCCGAAGAAATGGCCGTCACTCTCTTTCTCAGCTCAACTCAACTCACACTCTATATATATATACGTCCTTCCCGGCTCTTCCCCTTTGCATTCCTTTTCTCCTCTCTTTTTCCTCTCATTTTCAACGAGGGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985806
ATGAGAGACTACGCCGCCGCGTCTTCTCTCATCGTCGCCCTCGCACTGCTGCTTGCTCTACACGGCGTCAATGGCGACAACCCCTACAGATACTACACTTGGAAAGTCACCTACGGCGACATTTATCCTCTCGGCGTCAAACAACAGGGAATTCTGATAAATGGGCAGTTTCCGGGGCCGACGATCGACTGCGTCACTAATGACAACTTGATTATCAGCGTTTACAACTACTTAAATGAGCCATTTCTACTTTCCTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764924.1
MRDYAAASSLIVALALLLALHGVNGDNPYRYYTWKVTYGDIYPLGVKQQGILINGQFPGPTIDCVTNDNLIISVYNYLNEPFLLSWNGLQQRRNSWQDGVSGTNCPILPRRNYTYALQAKDQIGTYFYFPSLGLHKAAGGYGSIKVYSRPQIPVPFPPPAGDHVVLAGDWFKRSQRQLRYFVDGGHNLPFPDGLIINGRGWNGYTFTVEQGKTYRFRISNVGTALSLNFRIQGHLMKLVEVEGSHTVQNTYSSLDVHLGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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