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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001102`

染色体: Chr05 坐标: 9166328-9170099 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001102`
名称	SmilChr05G001102
描述	uncharacterized SmilChr05G001102
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9166328 - 9170099 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985808`
GeneID	`130985808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985808`
原始查询	`SmilChr05G001102`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U3 small nucleolar RNA-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828935]; symbol=AT4G28200; hit=AT4G28200; species=arabidopsis; confidence=high
产物	U3 small nucleolar RNA-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828935]; symbol=AT4G28200; hit=AT4G28200; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G28200` (AT4G28200) U3 small nucleolar RNA-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828935] identity=57.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0103900` (OJA1212_C06.1) - identity=48.1; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005515 (protein binding); GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0034388 (Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08640 (U3_assoc_6); PF24892 (UTP6_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764925.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057764925.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057764925.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057764925.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9167204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B75,C85,D3
`Chr5:9167299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B71,B77
`Chr5:9167461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B75,D3
`Chr5:9167474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9167630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B121,B136,B76,C53
`Chr5:9168612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C23,C5
`Chr5:9169132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:9169224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B42,B43,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764925.1

644 aa

322

644

U3_assoc_6

UTP6_C

PF08640 U3_assoc_6 9-91 aa PF24892 UTP6_C 342-632 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764925.1`	Pfam	`PF08640`	U3_assoc_6	Repeat	9	91	1.1e-27	96.5	U3 small nucleolar RNA-associated protein 6
`XP_057764925.1`	Pfam	`PF24892`	UTP6_C	Repeat	342	632	2.8e-19	70.8	U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908942.1
AAAAAGCCCACAAGTCAAGTGGAGACAGGTATTGAAACACAGAACCCTAGTTGAGCCCGTTAACAACTTCTCCTCCGTTCTCCCTCGACGCTGCACCCTTTTCTTCTTCGTCGCGCGCAGATAGACCGCCGCCGCCGTCGACAACGTCGTTAAGGAGCACGTTCACAGTGTTCAGCAACAATGGCGGACGTCGTTCAATTCAAGCTCGAGCGCATGCTCGACGAGCTAGACGACCTAGAGCGGCGCGGTTTGTTCAGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985808
ATGGCGGACGTCGTTCAATTCAAGCTCGAGCGCATGCTCGACGAGCTAGACGACCTAGAGCGGCGCGGTTTGTTCAGCCGCCGGGAGATAGCCGAAATAGTGAAAATGCGCCGCAAATTCGAGTACCGTCTTAAGCGGCCTAGTCCCCTAAAGGAAGATTTCTTGTCCTACATTGACTACGAAAAGCAGCTCGACGCTCTCCGCTCCCTCCGCAAAAAAGCTCTCGAAAGGAAATCCGGCGGCGAAAAGTCCAAAAAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764925.1
MADVVQFKLERMLDELDDLERRGLFSRREIAEIVKMRRKFEYRLKRPSPLKEDFLSYIDYEKQLDALRSLRKKALERKSGGEKSKKTISDFSGVTRILLIYRLATNRFKGDIELWFQYLEFCRTRGHGRMKKALAQLVRFHPKVSGVWIYAAAWEFDNNLNVEAARALMQNGLRSCPTSEDIWVEYLRMELTFLNKLKARKQALGEGKGNTARGNRNADEQQWRDENQDLFMSLDENGDVDKRSSSQDGDSEGKLDVFRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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