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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001105`

染色体: Chr05 坐标: 9177029-9178360 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001105`
名称	SmilChr05G001105
描述	probable F-box protein At4g22030
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9177029 - 9178360 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985811`
GeneID	`130985811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985811`
原始查询	`SmilChr05G001105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable F-box protein At4g22030
产物	probable F-box protein At4g22030
Arabidopsis	`AT4G22030` (AT4G22030) F-box protein with a domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828292] identity=53.9; qcov=0.855; evalue=2.83e-118; confidence=high
Rice	`Os02g0225900` - identity=46.6; qcov=0.944; evalue=2.53e-69; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14476 (Chloroplast_duf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764932.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057764932.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764932.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764932.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9177440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B17,B49
`Chr5:9177486`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A20,A23,A8,B102,B131,B137,B17,B39,B49,B57,B62,B78,B85,B86,C49,C52,C57,C69,C71,C73,C86,D7
`Chr5:9177506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:9177571`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A13,A20,A23,A5,A7,A8,B1,B105,B106,B122,B126,B131,B21,B36,B42,B47,B48,B5,B62,B75,B81,B83,B85,B90,C1,C2,C30,C4,C46,C50,C56,C69,C72,C75,C80,D11,D3,D5,D6,D7
`Chr5:9177597`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A15,A7,A8,B1,B115,B126,B132,B36,B5,B60,B69,B78,B84,B85,C10,C25,C52,C71,C84,D5
`Chr5:9177622`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B106,B132,B47,B63,B75,C18,C46,C78,D3,D6
`Chr5:9177770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:9177793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B45,C78,D6
`Chr5:9177795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:9177807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C10,C22,C42,D6
`Chr5:9177809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C10,C22,C42,D6
`Chr5:9177826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764932.1

393 aa

196

393

Chloroplast_duf

PF14476 Chloroplast_duf 74-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764932.1`	Pfam	`PF14476`	Chloroplast_duf	Family	74	369	7.6e-124	413.6	Petal formation-expressed

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908949.1
AATTCATCAATGGCTACACAATCTTCAATTTTTTCATCAATGCCTTGCGCCCATAATTCCATATTACGTCCCTCAAAGAAAAGAATTGTCGTCACAAATGCAAATATGTCTCTACATATGAAGGCAGATGATAAATTAACCGCCAAAATATCCACCAAAGACAACGGCAAAATCCCGATCATTCTCCAGCCATGCAGCCACGACACCGCCGCCGCCTCTGCTACGGCCAAGCTCTACGCCGTGTTGGAGGCGGTGGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985811
ATGGCTACACAATCTTCAATTTTTTCATCAATGCCTTGCGCCCATAATTCCATATTACGTCCCTCAAAGAAAAGAATTGTCGTCACAAATGCAAATATGTCTCTACATATGAAGGCAGATGATAAATTAACCGCCAAAATATCCACCAAAGACAACGGCAAAATCCCGATCATTCTCCAGCCATGCAGCCACGACACCGCCGCCGCCTCTGCTACGGCCAAGCTCTACGCCGTGTTGGAGGCGGTGGCCGATAGGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764932.1
MATQSSIFSSMPCAHNSILRPSKKRIVVTNANMSLHMKADDKLTAKISTKDNGKIPIILQPCSHDTAAASATAKLYAVLEAVADRVEMHANIGEQRNNWNSLLLNSINTMTLTATAMAGLTAAAPEPVLGLKLSSAALFAAATAMLVVVNKLQPSQLAEEQRNATRLFKGLHQEIQTALTLSDHVTETDVAKAMERVLALDRAYPLPLIGVMLEKFPAELEAAVWWPPLKKGEEQEMEEEMREIVSVLREKDKQEYLKLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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