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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001110`

染色体: Chr05 坐标: 9218760-9221520 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001110`
名称	SmilChr05G001110
描述	probable WRKY transcription factor 31
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9218760 - 9221520 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985817`
GeneID	`130985817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985817`
原始查询	`SmilChr05G001110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 31
产物	probable WRKY transcription factor 31
Arabidopsis	`AT4G04450` (WRKY42) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825775] identity=56.4; qcov=0.929; evalue=4.72e-144; confidence=high
Rice	`Os05g0137500` (OsWRKY5) - identity=49.2; qcov=0.623; evalue=3.67e-64; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764939.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764939.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764939.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764939.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9219025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:9219182`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr5:9219182`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr5:9219272`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B88
`Chr5:9219272`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B88
`Chr5:9219885`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	70	A10,A14,A16,A21,A25,A3,A6,B100,B107,B110,B111,B115,B117,B124,B127,B27,B30,B33,B38,B39,B44,B46,B47,B50,B6,B60,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B82,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B99,C11,C12,C14,C17,C18,C19,C22,C25,C26,C27,C29,C33,C42,C43,C45,C46,C47,C54,C55,C56,C65,C69,C7,C76,C8,C87,C9,D5,D9
`Chr5:9219908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:9219911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764939.1

506 aa

253

506

WRKY

PF03106 WRKY 276-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764939.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	276	333	1.1e-25	90.4	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908956.1
CGAAAACTAAAATATAATGTAGGAAATACCAAAGTGAGCTAGTCGTCAGTCACACAGAACGGATCGGGGCGTCAAATTGGTTGACTTTGTCTCTTTCCTTTCGTTTTCATCACGTGTAAAGTGCCGCATCGGTCGGGCCGGTGGATTCGTATTAGCTTTATAGTCTTCTCCAAACCGGCATTTTTCTTTTTCTAATTTTCTTCAATAATTTAGTAGCATAAATGGGAATGAGTCAAAGTTAGTCTTGACGAAATTTGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985817
ATGGACAGAGGATGGGGTCTGACCCTTGATAATTCTGATCAAGTTGGGTTTTTCGGTAACAAGGCGAGTTTCGGAGTGAATTTGAGTCCTCGTCGGAACAGCGGATTTATTATGTTTCCGAGGGGTAGAGAAGAACAACCGGAGCACCGGGAAGTGGACTTCTTCGCTGTCAAGAAGGAAGACTCACAAGCTCAACCGTCCGCCGCCACAGATTTCCATGTTAACACTGGTTTGCAACTTGTGACTGCTAATACCGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764939.1
MDRGWGLTLDNSDQVGFFGNKASFGVNLSPRRNSGFIMFPRGREEQPEHREVDFFAVKKEDSQAQPSAATDFHVNTGLQLVTANTGSDQSTVDDGVSYDGEDKRAKNELAQLQIELERMNGENQRLRGMLSQVSGNYASLQMHLVTLMQHQQNSTTQEQEMDDKKCEDERKENGGARQFLELGPEQSNSLSEERTVSGSPHQNNLEVTRNKRSGREESPESESWVPGSKAPRLNNPNPNINTNTNTNTNTNQSIEATMRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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