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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001116`

染色体: Chr05 坐标: 9312383-9314189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001116`
名称	SmilChr05G001116
描述	RPM1-interacting protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9312383 - 9314189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985822`
GeneID	`130985822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985822`
原始查询	`SmilChr05G001116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPM1-interacting protein 4-like
产物	RPM1-interacting protein 4-like
Arabidopsis	`AT3G25070` (RIN4) RPM1 interacting protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822098] identity=35.4; qcov=1.17; evalue=5.28e-26; confidence=medium
Rice	`Os03g0848600` - identity=27.7; qcov=1.34; evalue=8.74e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05627 (AvrRpt-cleavage)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764947.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057764948.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764947.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764947.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9312821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B130,C38,D5
`Chr5:9312952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B124,C17
`Chr5:9312952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C17
`Chr5:9312959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B65
`Chr5:9313408`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C2
`Chr5:9313408`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C2
`Chr5:9313459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr5:9313460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C2,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764947.1

179 aa

179

AvrRpt-cleavage

PF05627 AvrRpt-cleavage 4-31 aa PF05627 AvrRpt-cleavage 112-145 aa

XP_057764948.1

178 aa

178

AvrRpt-cleavage

PF05627 AvrRpt-cleavage 4-30 aa PF05627 AvrRpt-cleavage 111-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764947.1`	Pfam	`PF05627`	AvrRpt-cleavage	Domain	4	31	5.7e-28	96.7	Cleavage site for pathogenic type III effector avirulence factor Avr
`XP_057764947.1`	Pfam	`PF05627`	AvrRpt-cleavage	Domain	112	145	5.7e-28	96.7	Cleavage site for pathogenic type III effector avirulence factor Avr
`XP_057764948.1`	Pfam	`PF05627`	AvrRpt-cleavage	Domain	4	30	4.7e-28	96.9	Cleavage site for pathogenic type III effector avirulence factor Avr
`XP_057764948.1`	Pfam	`PF05627`	AvrRpt-cleavage	Domain	111	144	4.7e-28	96.9	Cleavage site for pathogenic type III effector avirulence factor Avr

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908964.1
ATCGAATCAACGTCTGCAACCCCTACTCCATTGTGATCTCCGATCGATAGCGTATCTGGCTAATGGAATGGACCCACGCGCAAACCCCACTTTTTTAATTTTCAACTTTTATTTTTTATTTTTTAAGTTTTGATGTTGTTGTTCGTCTTTTCTCTTTATCTTGGCGGACGTCGGATCTGGTTAGAGTTGTCTCAACTCTCAAGACTCAGAATTGATCAGAAACAAGAAACAAATTTTGATAATTAAGGATTCATGGCTCA...

XM_057908965.1
GCAACCCCTACTCCATTGTGATCTCCGATCGATAGCGTATCTGGCTAATGGAATGGACCCACGCGCAAACCCCACTTTTTTAATTTTCAACTTTTATTTTTTATTTTTTAAGTTTTGATGTTGTTGTTCGTCTTTTCTCTTTATCTTGGCGGACGTCGGATCTGGTTAGAGTTGTCTCAACTCTCAAGACTCAGAATTGATCAGAAACAAGAAACAAATTTTGATAATTAAGGATTCATGGCTCAATCGCATGTGCCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985822
ATGGCTCAATCGCATGTGCCTAAGTTCGGAAACTGGGAAGGTGAGAACGTACCATACACGGCCTTCTTTGAGAATGCGCGCAAAGAAAAAGCAAGCGGCATTAGAATTAATCCAAACGATCCAGAGCAGAATCCGGAGGCCTTCTTCAATAATGGTCCAAGTCCGGATAATGAGGTGCCAGCGCCAAGGTTTGGTAGACATAGAAGCTCATACGATGGTAGCCATAGGACATTGTCTTCCGGATCAAGCAGCAATGCTAC...

LOC130985822
ATGGCTCAGCAATCGCATGTGCCTAAGTTCGGAAACTGGGAAGGTGAGAACGTACCATACACGGCCTTCTTTGAGAATGCGCGCAAAGAAAAAGCAAGCGGCATTAGAATTAATCCAAACGATCCAGAGCAGAATCCGGAGGCCTTCTTCAATAATGGTCCAAGTCCGGATAATGAGGTGCCAGCGCCAAGGTTTGGTAGACATAGAAGCTCATACGATGGTAGCCATAGGACATTGTCTTCCGGATCAAGCAGCAATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764947.1
MAQQSHVPKFGNWEGENVPYTAFFENARKEKASGIRINPNDPEQNPEAFFNNGPSPDNEVPAPRFGRHRSSYDGSHRTLSSGSSSNATSVNPLKLKHHRNKSDNNNADEFSHRSVSVPKFGQWNENDPRSGDGFTVIFNKVKEEKHIAAAKFPPVPLQTTNNYQASPEKETRKKCCCLF

XP_057764948.1
MAQSHVPKFGNWEGENVPYTAFFENARKEKASGIRINPNDPEQNPEAFFNNGPSPDNEVPAPRFGRHRSSYDGSHRTLSSGSSSNATSVNPLKLKHHRNKSDNNNADEFSHRSVSVPKFGQWNENDPRSGDGFTVIFNKVKEEKHIAAAKFPPVPLQTTNNYQASPEKETRKKCCCLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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