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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001122`

染色体: Chr05 坐标: 9356991-9359244 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001122`
名称	SmilChr05G001122
描述	tyrosine-protein phosphatase DSP1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9356991 - 9359244 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985827`
GeneID	`130985827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985827`
原始查询	`SmilChr05G001122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tyrosine-protein phosphatase DSP1-like
产物	tyrosine-protein phosphatase DSP1-like
Arabidopsis	`AT1G05000` (PFA-DSP1) Phosphotyrosine protein phosphatases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839348] identity=66.2; qcov=0.835; evalue=2.15e-91; confidence=high
Rice	`Os09g0135700` (OsPFA-DSP1) - identity=73.4; qcov=0.687; evalue=7.6e-85; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03162 (Y_phosphatase2); PF13350 (Y_phosphatase3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764958.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764958.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057764958.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764958.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9357489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr5:9357655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:9358814`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B121
`Chr5:9358814`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B121
`Chr5:9358960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764958.1

230 aa

115

230

Y_phosphatase2

Y_phosphatase3

PF03162 Y_phosphatase2 71-222 aa PF13350 Y_phosphatase3 151-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764958.1`	Pfam	`PF03162`	Y_phosphatase2	Domain	71	222	4.5e-63	212.5	Tyrosine phosphatase family
`XP_057764958.1`	Pfam	`PF13350`	Y_phosphatase3	Domain	151	198	2.2e-05	25.3	Tyrosine phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908975.1
CGTTTGGATGAGTCTAATATATAATCCTTCACCTTATGTTTTGTAGTTACGATGATTATTTGAAGAGAAATTCGATAAGAGAATCCAGTGAAATAATAATAAAATTGAATGTGTAGTTAGTGTTTGATTATATAAGGGCAAGTGGCAACTCCCTTTGGCTTTTGGGTGCAAAGGTAAAGTTAAAAGGCAGTCGGCAGCCGCGATTGAACAATGCATATACGAAATACGAATGGGCATCTGTCCGCGGCCGTCCCCGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985827
ATGCATATACGAAATACGAATGGGCATCTGTCCGCGGCCGTCCCCGATTCTTCACGGTCCGATCATGCGAATGATATGAGCATCCACAATTGCCGCGGTCCAATGTGCCTCAAAACCGTCCAACCGTCTCACGCCACGCCTGCCGCCGCCGCCGCTATGTCGCCGGAAAACTCCGTTGCCGCCGACGTTAACGCTGAAGACCATCTATTCGTGCCTCCGCTCAATTTTTCCATGGTGGATTACGGAATATACCGCTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764958.1
MHIRNTNGHLSAAVPDSSRSDHANDMSIHNCRGPMCLKTVQPSHATPAAAAAMSPENSVAADVNAEDHLFVPPLNFSMVDYGIYRSGFPDAANFPFLKTLGLRSIIYLCPEPYPEENMQFLNANGIRLFQFGLEGSKELFVNIPEDLIVCALRVLLDERNHPLLIHCKRGKHRTGCLVGCLRKWQNWCLASIFDEYQRFAADKARVTDQRFMELFDISRIKKLASSPPYM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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