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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001124`

染色体: Chr05 坐标: 9370352-9371949 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001124`
名称	SmilChr05G001124
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9370352 - 9371949 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985828`
GeneID	`130985828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985828`
原始查询	`SmilChr05G001124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 3-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 3-like
Arabidopsis	`AT1G05010` (EFE) ethylene-forming enzyme [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839345] identity=72.5; qcov=1.03; evalue=1.4e-180; confidence=high
Rice	`Os09g0451400` (ACO2) - identity=71.5; qcov=1.02; evalue=1.28e-169; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764959.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764959.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764959.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764959.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9370968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C82
`Chr5:9371630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,D2
`Chr5:9371678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D1
`Chr5:9371692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B7
`Chr5:9371694`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A21,A7,A9,B107,B120,B122,B128,B20,B22,B28,B42,B43,B48,B53,B59,B6,B61,B68,B91,B98,C22,C30,C48,C49,C52,C57,C58,C61,C67,C74,C78,C85,D1,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764959.1

314 aa

157

314

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 5-95 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 159-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764959.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	5	95	3.4e-16	60.7	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057764959.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	159	253	1.9e-34	118.7	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908976.1
AGATTGACTCAACGCAAGTTCTAGGAAGGAAGGCCGTGGAATGGAAAAATGGTTATGATAATAAATGGGATTAATTAACATAATTTAATTTTTGTGAAGGGATTAGCAACATAATTAAGAGACGTCATTATCCATCCCCTTAATTCCACGCCTATAAATACCGCAGCCCTGTACACACACCACATCAATTCATCACAAAAACAACTTACTTTACTTTGCAATACGCATATACAACAAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985828
ATGGCAAGTTTCCCAGTGATCAGCTTGGAGAAGATCAATGGAGAAGAGAGGGCTGCAGTGTTGGAGCAGATCAAAGACGCATGCGAAAACTGGGGTTTCTTCGAGCTGGTGAATCATGGAATCGCTCCTGAGTTCATGGACAAAGTGGAGAAATTGACCAAGGAGCACTACCGGAAATGTATGGAGCAGCGCTTCAACGAAATGGTGGCCAGCAAGGGCCTCGAGGCCGTTCAGTCCGAAATCGACGACCTCGACTGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764959.1
MASFPVISLEKINGEERAAVLEQIKDACENWGFFELVNHGIAPEFMDKVEKLTKEHYRKCMEQRFNEMVASKGLEAVQSEIDDLDWESTFFLRHLPISNISEIPDLDQEYREVMREFAAKLEVLAEELLDLLCENLGLEKGYLKKAFCGSKGPTFGTKVSNYPPCPKPDLIKGLRAHTDAGGIILLFQDDKVSGLQLLKDGEWVDVPPMRHSIVINIGDQLEVITNGRYKSVMHRVIAQTDGTRMSLASFYNPGSDAVIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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