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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001127`

染色体: Chr05 坐标: 9415430-9416966 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001127`
名称	SmilChr05G001127
描述	light-induced protein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9415430 - 9416966 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985831`
GeneID	`130985831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985831`
原始查询	`SmilChr05G001127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	light-induced protein, chloroplastic-like
产物	light-induced protein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G22240` (AT4G22240) Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828319] identity=60.1; qcov=0.984; evalue=1.42e-119; confidence=high
Rice	`Os09g0133600` (PAP2) - identity=69.6; qcov=0.752; evalue=9.95e-111; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04755 (PAP_fibrillin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764964.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764964.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057764964.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764964.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9415603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B140
`Chr5:9415625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9415639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C83
`Chr5:9416319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B30
`Chr5:9416346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:9416391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:9416414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr5:9416572`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr5:9416572`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr5:9416691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:9416724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,C27,C44,C49,C71
`Chr5:9416800`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A10,B126,B9,C27,C44,C49,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764964.1

306 aa

153

306

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 80-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764964.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	80	295	5.7e-70	236.0	PAP_fibrillin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908981.1
ATTCAATATAAGGAGTCGGCATTAACAGTTTCTTCCGAAAATGGCAGCTTCCATGCCTTGTGTAAACAACTTCTTCTCATGTAAAACCCTCCCACATTCCTCTGAAAACCTCGTTAAAAATGCATCATCTCCTACTAAACGAACCAGTTTTTCCGCCCTCCCGATCAGAAAAACGATGAAGACGAAGCGGAATTTCAGGGTGAGGGCGGCGATCGCAAATGATGAGCCACCGGTTCGAGGAGTGTCAATTCTGGAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985831
ATGGCAGCTTCCATGCCTTGTGTAAACAACTTCTTCTCATGTAAAACCCTCCCACATTCCTCTGAAAACCTCGTTAAAAATGCATCATCTCCTACTAAACGAACCAGTTTTTCCGCCCTCCCGATCAGAAAAACGATGAAGACGAAGCGGAATTTCAGGGTGAGGGCGGCGATCGCAAATGATGAGCCACCGGTTCGAGGAGTGTCAATTCTGGAGGAGGAGACGGAAATTGAGGTACTGAAGAAACAAGTTTTGGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764964.1
MAASMPCVNNFFSCKTLPHSSENLVKNASSPTKRTSFSALPIRKTMKTKRNFRVRAAIANDEPPVRGVSILEEETEIEVLKKQVLESFCGANMGLSASSETRAEIVELITHLEAKNPNPAPTQALTLLNGKWILAYTSFLEFYPLLSREGAFPLVKVEEISQTFDSDNFTVQNSIVFSGPLATTSLTTNAKFEVRSPKRVQIKLEQGVIGTPQLTDSVVLPENIEFLGQNIDLAPFKGLLTSLRDTASSVARSISSQPPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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