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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001135`

染色体: Chr05 坐标: 9489770-9497238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001135`
名称	SmilChr05G001135
描述	homeobox protein SBH1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9489770 - 9497238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985837`
GeneID	`130985837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985837`
原始查询	`SmilChr05G001135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox protein SBH1-like
产物	homeobox protein SBH1-like
Arabidopsis	`AT1G62360` (STM) KNOX/ELK homeobox transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842534] identity=60.1; qcov=1.07; evalue=1.89e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0771500` (OsH43) - identity=52.7; qcov=0.976; evalue=5.92e-70; confidence=high
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF03789 (ELK); PF03790 (KNOX1); PF03791 (KNOX2); PF05920 (Homeobox_KN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764970.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057764970.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057764970.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764970.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9496702`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr5:9496702`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr5:9496992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764970.1

208 aa

104

208

KNOX1

KNOX2

ELK

Homeobox_KN

Homeodomain

PF03790 KNOX1 12-45 aa PF03791 KNOX2 60-103 aa PF03789 ELK 121-140 aa PF05920 Homeobox_KN 160-199 aa PF00046 Homeodomain 168-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764970.1`	Pfam	`PF03790`	KNOX1	Family	12	45	1.3e-17	64.0	KNOX1 domain
`XP_057764970.1`	Pfam	`PF03791`	KNOX2	Family	60	103	2.2e-20	72.6	KNOX2 domain
`XP_057764970.1`	Pfam	`PF03789`	ELK	Family	121	140	3.4e-06	27.5	ELK domain
`XP_057764970.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	160	199	1.4e-18	67.1	Homeobox KN domain
`XP_057764970.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	168	200	3.1e-07	30.8	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908987.1
TTCACTTTATAATATGCAATGCTACAACACTAGTTTGTCTTGTTCTGCTCACCCTATCGCCAATACCCTTCCTTCTTCCGATCTAAATCGCCATGACGTCGCCGCCGGAGGAACTTCACACACACAAAATCATGTCTCACCCTTACTATCACCGCCTCTTGGCTGCTTATGTTAACTGTCAAAAGATAGGAGCTCCAGCTGAAATGGCGGCGAGACTGGAGGAAGCAGGCGGTTGTGCGATGAGGGGTAGTGGTGGCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985837
ATGACGTCGCCGCCGGAGGAACTTCACACACACAAAATCATGTCTCACCCTTACTATCACCGCCTCTTGGCTGCTTATGTTAACTGTCAAAAGATAGGAGCTCCAGCTGAAATGGCGGCGAGACTGGAGGAAGCAGGCGGTTGTGCGATGAGGGGTAGTGGTGGCATGGAGAGTGGAGATCCGGCGCTTGACCAATTCATGGAAGCTTACTGTGAAATGCTGATCAAGTACGAGCAAGAACTCTCTAAACCCTTGACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764970.1
MTSPPEELHTHKIMSHPYYHRLLAAYVNCQKIGAPAEMAARLEEAGGCAMRGSGGMESGDPALDQFMEAYCEMLIKYEQELSKPLTEATLFLARIEHQFQALTAASACLSHSEGAAEDEQLKGELLKKYRGCLGSLKQELGKKKKGGKLPKEGRQKLLNWWTTHYIWPYPSEADKVALAESTGLEQKQINNWFINQRKRHWKPSFQHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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