当前解析结果
SmilChr05G001142| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001142 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001142 |
| 描述 | probable long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 9547274 - 9813532 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985853 |
|---|---|
| GeneID | 130985853 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985853 |
| 原始查询 | SmilChr05G001142 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase 5 |
| 产物 | probable long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase 5 |
| Arabidopsis | AT5G55350 (AT5G55350)MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835628] identity=42.7; qcov=0.923; evalue=9.88e-87; confidence=medium |
| Rice | Os02g0454500- identity=35.8; qcov=0.939; evalue=1.15e-56; confidence=medium |
| GO | GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13813 (MBOAT_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985853 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057765000.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057765000.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765000.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765000.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765000.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:9812449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:9812552 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C73,D6 |
Chr5:9812864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr5:9812956 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr5:9812993 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr5:9813150 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr5:9813263 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C17 |
Chr5:9813444 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,C42 |
Chr5:9813457 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D5 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765000.1PF13813
MBOAT_2 194-280 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765000.1 |
Pfam | PF13813 |
MBOAT_2 | Family | 194 | 280 | 3e-18 | 66.5 | Membrane bound O-acyl transferase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。