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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001144`

染色体: Chr05 坐标: 9563005-9568744 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001144`
名称	SmilChr05G001144
描述	lysine-specific demethylase JMJ26-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9563005 - 9568744 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985865`
GeneID	`130985865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985865`
原始查询	`SmilChr05G001144`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-specific demethylase JMJ26-like
产物	lysine-specific demethylase JMJ26-like
Arabidopsis	`AT1G11950` (AT1G11950) Transcription factor jumonji (jmjC) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837747] identity=54.8; qcov=0.671; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0393200` (JMJ718) - identity=60.3; qcov=0.359; evalue=1.09e-160; confidence=low
GO	GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0000785 (chromatin); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0031490 (chromatin DNA binding); GO:0032454 (histone H3K9 demethylase activity); GO:0033169 (GO:0033169)
KEGG	-
Pfam	PF02373 (JmjC); PF10497 (zf-4CXXC_R1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765013.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057765013.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765013.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765013.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9563750`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	109	A1,A13,A15,A18,A2,A25,A7,A8,B1,B101,B103,B105,B107,B108,B110,B111,B114,B117,B121,B122,B127,B128,B13,B131,B137,B139,B19,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B46,B49,B53,B54,B55,B60,B61,B62,B65,B69,B70,B71,B74,B76,B77,B78,B81,B82,B84,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B98,C1,C11,C12,C15,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C25,C26,C31,C36,C4,C43,C44,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C58,C6,C60,C61,C62,C65,C69,C70,C71,C75,C76,C78,C80,C82,D1,D2,D3,D6,D7
`Chr5:9564079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C19,C58
`Chr5:9564223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B61,B77
`Chr5:9564309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:9564337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:9564411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B40,B85
`Chr5:9564416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B2,C42,C87
`Chr5:9564453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C13
`Chr5:9564476`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A1,A16,A20,B108,B136,B18,B26,B27,B39,B47,B49,B56,B6,B82,B95,B96,C10,C21,C29,C40,C43,C47,C59,C67,C70,D4,D7,D8
`Chr5:9564606`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A16,B136,B17,B26,B27,B47,B56,B6,B82,B95,B96,C10,C29,C43,C59,C70,D4
`Chr5:9564696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:9564721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,C81,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765013.1

1094 aa

547

1094

zf-4CXXC_R1

JmjC

PF10497 zf-4CXXC_R1 385-455 aa PF02373 JmjC 933-1030 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765013.1`	Pfam	`PF10497`	zf-4CXXC_R1	Domain	385	455	3.3e-05	24.7	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1
`XP_057765013.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	933	1030	2.8e-13	51.0	JmjC domain, hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909030.1
TATTAGCAATAGTTATACAACAGCAGCAGCGGCTTTCTGCAGCATCTTCGTTTCCGTTAATTTTCTTCTTTACGTGTCTTTTCTGTCTCGAATGCGATTCACATATCAATGCGTATTCGGCAAAATATATATTTTTAAATCCAAATCTTCTTTGATTCCTCCACATCGCTACCGCAATTTGCTTTTCTTTGATTTCGTTTCTTACGCGTCGAAGCGCCTGCTGCTAAATTAATTGGATTTCGGGGAGGAAAGTGCTGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985865
ATGGATGAGAGAACTTCCTATGATCTCGATCCGGTCGTAAACAACATAAAGAAAATGCTTTCTAGGTTAGATGTTTTCCACCTTGGTTATGGTCTGGCTGGTTTGGTGATGGCAGTATTGATCACAAAGCAAGAACAACATCGTCGTTGCACAAACAATGATATGCCATTGAGGCCAAGAAGCCTGAGACATGCGCCTGCAAGGAAGAGGAAGTTAATCATTGATATAGAGGATGAGGAAGAATGTGATGGAAACATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765013.1
MDERTSYDLDPVVNNIKKMLSRLDVFHLGYGLAGLVMAVLITKQEQHRRCTNNDMPLRPRSLRHAPARKRKLIIDIEDEEECDGNIELLPAEPGDLSNQRTIGSSHISYSVISTTTHQMFPIIKVPKAKRSFSRRKGMGTQRVADAEVGSSSVDKLVPSKKTCRPHSFGELNYYSLDEEDEGRFRSLRKLSKKEHTLKHIMATTETKGFLEKEYSGKVCKVSNEKKICRNKLKRKKVESDSEQEWEEHKKKKGVSVVLSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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