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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001147`

染色体: Chr05 坐标: 9600850-9604660 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001147`
名称	SmilChr05G001147
描述	uncharacterized membrane protein At1g16860
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9600850 - 9604660 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985848`
GeneID	`130985848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985848`
原始查询	`SmilChr05G001147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin-specific protease family C19-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828324]; symbol=AT4G22290; hit=AT4G22290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin-specific protease family C19-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828324]; symbol=AT4G22290; hit=AT4G22290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G22290` (AT4G22290) Ubiquitin-specific protease family C19-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828324] identity=59.5; qcov=1.04; evalue=1.27e-177; confidence=high
Rice	`Os08g0230200` - identity=49.5; qcov=1.1; evalue=6.1e-146; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057764993.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057764993.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057764993.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764993.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9601282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B117,B46,C85
`Chr5:9601569`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C4
`Chr5:9601569`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C4
`Chr5:9601683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C19,C58
`Chr5:9603549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C15
`Chr5:9603824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B47,B85,B86,C51
`Chr5:9603848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B46,C2,C85
`Chr5:9604034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B117,C85
`Chr5:9604070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B117,B46
`Chr5:9604145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B138,B18
`Chr5:9604180`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B20
`Chr5:9604180`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909010.1
ATCCGGTGCTCCAACTTTTCATTTAACTGAGTGTTAAGCATTTTAAATGCAAAATAAATCGCGATGCTCCTAGTTTTCATTTAACAAAGAGTGGGGGTTGTCAACACCACCTAATCCATAATTAGTGAAGTAACTCCGTAAATTAGACGAGCATTAATAGGTGAAAATGTGAGATGGAAAATTGCAGAATCCCAACACAACACAGAGCATGACAGCAAATCACAGACCAAAGTGTTGCCAACACAGAGACAAAGGATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985848
ATGAGTGTCCGAAGTGGGTCGCACCAGCTCAGTAACGGCCTCATGGTCTCGGGCCGCCCCGAGCAGCAGCTCAAGGAGCGCCAGCCCACAATGGGCTCACGCGCCGTTCCCTACACCGGCGGCGACGTCAAGAAATCCGGCGAGCTCGGCAGAATGTACGGGGTCGACCTCTCCACTGGGGACCACCACCATCACCCGCCGCCCCCCAAGCTCCCCTCGCGCCAGCCCTCTTCCTCCCAGCATAACAGCGGATCTGCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764993.1
MSVRSGSHQLSNGLMVSGRPEQQLKERQPTMGSRAVPYTGGDVKKSGELGRMYGVDLSTGDHHHHPPPPKLPSRQPSSSQHNSGSARSGPNSGQLGKNSGPMSKKSSSSSFSGPMTPIQPTGLITSGPLGSSSSNRRSGQLDAPAAPSSFKKVAYGSAVTSLGDEVRLGFRVSRVAMWMFLVVVVMGLVVGVFLMASVKKPIILVAVVAVLVPIVMIFVWNYAYRNRGVLGFLNKYPDAELRGAVDGQFVKVTGVVTCGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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