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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001155`

染色体: Chr05 坐标: 9686438-9689276 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001155`
名称	SmilChr05G001155
描述	uncharacterized SmilChr05G001155
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9686438 - 9689276 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025497`
GeneID	`131025497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025497`
原始查询	`SmilChr05G001155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=46.5; qcov=0.287; evalue=2.29e-42; confidence=weak
Rice	`Os04g0357300` - identity=40.7; qcov=0.378; evalue=4.42e-56; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811274.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811274.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811274.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811274.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9686443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:9686466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:9686491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C29,C7
`Chr5:9686503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B72
`Chr5:9686515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B3,B72,C79
`Chr5:9686520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B3,B72,C79
`Chr5:9686530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B1,B103,B129,B139,B22,B3,B61,B71,B80,B81,C65,C87
`Chr5:9686533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B3,B72,C74,C79
`Chr5:9686557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B125,B3,B72,C74,C79
`Chr5:9686557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B3,B72,C74,C79
`Chr5:9686566`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B125,B3,B72,C74,C79
`Chr5:9686566`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B125,B3,B72,C74,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811274.1

638 aa

319

638

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 281-463 aa PF21530 Pif1_2B_dom 478-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811274.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	281	463	3.7e-82	276.0	PIF1-like helicase
`XP_057811274.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	478	524	6.5e-21	74.5	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955291.1
ATGGATTCAGATCCAAAGTATTATACAGCTGTACATGATTTCATGCTTCATGGTCCATGTGGAGTAGCAAAGAAAAATTCACCTTGCATGGCAAATGGTCGTTGCACGAAATATTTTCCCAAAAAATATGTTGAGACAACGACTGTTGATGAAGATTGTTATCCAGTATATAGGCGTAGAAATCATGGAAGGACAATTATGAAGAATGGTGTGCCTTTGGACAATAGATATGTTGTTCCACATAATCGTTATCTTCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025497
ATGGATTCAGATCCAAAGTATTATACAGCTGTACATGATTTCATGCTTCATGGTCCATGTGGAGTAGCAAAGAAAAATTCACCTTGCATGGCAAATGGTCGTTGCACGAAATATTTTCCCAAAAAATATGTTGAGACAACGACTGTTGATGAAGATTGTTATCCAGTATATAGGCGTAGAAATCATGGAAGGACAATTATGAAGAATGGTGTGCCTTTGGACAATAGATATGTTGTTCCACATAATCGTTATCTTCTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811274.1
MDSDPKYYTAVHDFMLHGPCGVAKKNSPCMANGRCTKYFPKKYVETTTVDEDCYPVYRRRNHGRTIMKNGVPLDNRYVVPHNRYLLMKYGAHINVEWCNQSRSIKYLFKYINKGNDRVTVSFYKSTNDGHMEKNVDEEACYAMGLLNDDREYIDGIVEASCWASAKSLRKLFITLLSSDSFGSVADVWNACWIYLSDDILYNQRTLLLHPELQLTEDQIKCYTLVEIEKLLSSFGRTLREFEGIPYPSSEFFEIDQNILI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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