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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001158`

染色体: Chr05 坐标: 9706437-9708422 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001158`
名称	SmilChr05G001158
描述	uncharacterized SmilChr05G001158
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9706437 - 9708422 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985856`
GeneID	`130985856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985856`
原始查询	`SmilChr05G001158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF506 family protein (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842540]; symbol=AT1G62420; hit=AT1G62420; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF506 family protein (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842540]; symbol=AT1G62420; hit=AT1G62420; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G62420` (AT1G62420) DUF506 family protein (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842540] identity=46.1; qcov=0.849; evalue=2.13e-61; confidence=high
Rice	`Os11g0437600` - identity=36; qcov=1.01; evalue=1.7e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765003.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765003.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765003.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765003.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9706699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B38,B39
`Chr5:9706752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:9706762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:9706781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:9707762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B124,B23,C17
`Chr5:9707766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B14,C61,D4
`Chr5:9708055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:9708061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:9708097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765003.1

299 aa

150

299

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 36-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765003.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	36	241	2e-62	211.7	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909020.1
ATACATGTATATATCGACAAGATGTCTTCATCCATACACTTAAGTGACTCCATTTTGTTCTACAGTCCGCAGATGTAAACATCGTTGTACCATAATCACGACATCTTGCTCGCCTAAACTCCATATTAACATCTTTCCCTCTCTCTCTATAAAAGCTTCCAGCAACCGTAACCGTCGTCTTCCATCCCATCACATTCTCTCTAAAGTTGTAGCTGCGTATACTAGCTAGAAGAAACAGTTGGAAAGAGACATTAATTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985856
ATGGTGAATATTCCGGTGAGGTTCGAACGGGTGGCGGCCGCCTTTGACGAGATGTCGAGAGATAGGTCGTTCGAGAGCAGCGGCAGCGAACACTCGGCCGATTTGTCTGATCTTGTCAACTCCTTCTTCGAGAGAGAAATTAGGGAGCAGGGCATCGGCGGAGATGCCGATCCAGACGGAAATGAGATTGAGATCGACGACGATGAATCTGAAAGTAACTCGCAGGACTCCCAATTTCATGATTCCTTGAGAAAATTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765003.1
MVNIPVRFERVAAAFDEMSRDRSFESSGSEHSADLSDLVNSFFEREIREQGIGGDADPDGNEIEIDDDESESNSQDSQFHDSLRKLFDRQDGGVRRRISAAVEKALEAVGDKDSSPEFKRRLMARLRSSGFDAGICKSKWEKSGSTPSGNYEYIDVNAGGSRYIVEVPFAGKFTIARPSAAYTALLDGFPTIFVGKAEELKQVVRQMSKAIRKSLKSVGLTVPPWRRLSYMQAKWLGSYKRTTNEIPRAEAFKDLGGNRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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