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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001169`

染色体: Chr05 坐标: 9798565-9802629 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001169`
名称	SmilChr05G001169
描述	fumarylacetoacetase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9798565 - 9802629 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985847`
GeneID	`130985847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985847`
原始查询	`SmilChr05G001169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fumarylacetoacetase
产物	fumarylacetoacetase
Arabidopsis	`AT1G12050` (AT1G12050) fumarylacetoacetase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837757] identity=76.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0196800` (FAH) - identity=68.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004334 (fumarylacetoacetase activity); GO:0006559 (L-phenylalanine catabolic process); GO:0006572 (L-tyrosine catabolic process); GO:1902000 (homogentisate catabolic process)
KEGG	smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01557 (FAA_hydrolase); PF09298 (FAA_hydrolase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764992.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057764991.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057764992.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764991.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9798879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:9799595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:9799615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:9799860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B19,B28,C40
`Chr5:9799990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B140
`Chr5:9800767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C5
`Chr5:9800781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:9801542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:9801772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B14,C61,D4
`Chr5:9802171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B88,D11
`Chr5:9802258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B97,C14,C35,C6
`Chr5:9802313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764991.1

448 aa

224

448

FAA_hydrolase_N

FAA_hydrolase

PF09298 FAA_hydrolase_N 18-122 aa PF01557 FAA_hydrolase 130-393 aa

XP_057764992.1

420 aa

210

420

FAA_hydrolase_N

FAA_hydrolase

PF09298 FAA_hydrolase_N 18-122 aa PF01557 FAA_hydrolase 130-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764991.1`	Pfam	`PF09298`	FAA_hydrolase_N	Domain	18	122	1.5e-35	122.2	Fumarylacetoacetase N-terminal
`XP_057764991.1`	Pfam	`PF01557`	FAA_hydrolase	Domain	130	393	5.8e-39	134.7	Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase C-terminal
`XP_057764992.1`	Pfam	`PF09298`	FAA_hydrolase_N	Domain	18	122	1.3e-35	122.4	Fumarylacetoacetase N-terminal
`XP_057764992.1`	Pfam	`PF01557`	FAA_hydrolase	Domain	130	396	2.9e-39	135.7	Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909008.1
AATTTGTAATGTCGGGTTCGGATAGCCCCAATTTTTGGGGGAGTAGAGAAAATCTGATACCTCTAGTTCTACCTAACACTCAAACTTGAAAATCCAAACTCATCAACTTTGATTCTCATTAATATTATCCGACTCCATTTCCGGCCCGCCTTCATTTATTATAAACTAACTTTTTCACTCTTGCTCCTCACTCCCTCTCCGTCTCTCTCTCATCTCCAGCGCTCCGGCCGACGGCATCGTTTCATCCGTCACTGGTTTGA...

XM_057909009.1
AATTTGTAATGTCGGGTTCGGATAGCCCCAATTTTTGGGGGAGTAGAGAAAATCTGATACCTCTAGTTCTACCTAACACTCAAACTTGAAAATCCAAACTCATCAACTTTGATTCTCATTAATATTATCCGACTCCATTTCCGGCCCGCCTTCATTTATTATAAACTAACTTTTTCACTCTTGCTCCTCACTCCCTCTCCGTCTCTCTCTCATCTCCAGCGCTCCGGCCGACGGCATCGTTTCATCCGTCACTGGTTTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985847
ATGGTGCTTAAGTCATTCATCGAAGTCCACCCGGACTCGCACTTCCCAATTCAGAACCTGCCGTACGGCGTGTTCAAGCGCCAACCGGATTCAGAGCCCAGACCGGGTGTTGCCATCGGAGACTATGTGCTGGACCTCTCCGTAGTTGCGTCGGCCGGTCTCTTCGACGGTCCCTTTCTCAGGAACTCCCACTGTTTCAATCAGCCTAATCTCAACAATTTCTTGGAATTGGGGCGTCCTGCGTGGAAGGAAGCTCGTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764991.1
MVLKSFIEVHPDSHFPIQNLPYGVFKRQPDSEPRPGVAIGDYVLDLSVVASAGLFDGPFLRNSHCFNQPNLNNFLELGRPAWKEARTTLQKLLSAAEPILRDNAILREKALVPTSEVQMLLPIAIGDYSDFFASKHHAYNCGVMFRGPDNAINPNWFHIPIAYHGRASSIVISGTDIIRPSGQGHPAGNSLPYFGPSRKLDFELEMATVVGPGNELGKPVDVNEAANHIFGLVLMNDWSARDIQAWEYVPLGPFLGKSFG...

XP_057764992.1
MVLKSFIEVHPDSHFPIQNLPYGVFKRQPDSEPRPGVAIGDYVLDLSVVASAGLFDGPFLRNSHCFNQPNLNNFLELGRPAWKEARTTLQKLLSAAEPILRDNAILREKALVPTSEVQMLLPIAIGDYSDFFASKHHAYNCGVMFRGPDNAINPNWFHIPIAYHGRASSIVISGTDIIRPSGQGHPAGNSLPYFGPSRKLDFELEMATVVGPGNELGKPVDVNEAANHIFGLVLMNDWSARDIQAWEYVPLGPFLGKSFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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