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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001171`

染色体: Chr05 坐标: 9806094-9809339 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001171`
名称	SmilChr05G001171
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 6-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9806094 - 9809339 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025499`
GeneID	`131025499`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025499`
原始查询	`SmilChr05G001171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 6-like
产物	mannan endo-1%2C4-beta-mannosidase 6-like
Arabidopsis	`AT4G28320` (MAN5) Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828947] identity=45.7; qcov=0.921; evalue=2.62e-117; confidence=high
Rice	`Os06g0311600` (MAN6) - identity=56.1; qcov=0.933; evalue=3.93e-146; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0071704 (GO:0071704)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00150 (Cellulase); PF26410 (GH5_mannosidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025499

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057811277.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811277.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811277.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811277.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9807337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:9807341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B140
`Chr5:9807357`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	106	A1,A11,A13,A14,A15,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B105,B109,B112,B114,B115,B117,B118,B121,B122,B125,B126,B127,B128,B131,B135,B136,B137,B138,B140,B16,B17,B20,B22,B24,B3,B39,B46,B47,B48,B52,B53,B54,B61,B64,B66,B69,B72,B75,B77,B78,B80,B81,B82,B85,B89,B91,B93,B98,B99,C11,C12,C13,C2,C23,C25,C30,C37,C38,C39,C4,C41,C46,C49,C50,C51,C53,C56,C58,C59,C60,C61,C65,C69,C7,C72,C74,C77,C78,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D3,D5,D6
`Chr5:9807399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B55
`Chr5:9807543`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	116	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A2,A20,A21,A25,A3,A7,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B105,B107,B109,B112,B114,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B125,B127,B128,B129,B131,B135,B136,B137,B14,B140,B16,B17,B20,B22,B24,B3,B32,B34,B36,B38,B39,B47,B53,B59,B61,B64,B65,B66,B69,B7,B72,B73,B74,B75,B78,B80,B85,B87,B88,B89,B9,B91,B93,B98,B99,C11,C13,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C30,C31,C33,C34,C37,C39,C4,C41,C46,C49,C50,C51,C53,C55,C56,C58,C59,C69,C7,C72,C74,C77,C78,C8,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D3,D9
`Chr5:9807747`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	102	A1,A10,A16,A18,A19,A23,A4,A8,B100,B101,B104,B106,B110,B113,B117,B12,B120,B124,B125,B13,B130,B134,B137,B15,B19,B22,B26,B27,B28,B30,B35,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B46,B49,B50,B52,B54,B55,B58,B59,B62,B64,B67,B69,B7,B70,B71,B76,B77,B79,B83,B88,B89,B91,B94,B95,B98,B99,C10,C12,C14,C16,C18,C20,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C30,C32,C33,C35,C40,C44,C45,C47,C48,C5,C51,C52,C54,C57,C63,C68,C7,C71,C76,C80,C82,C87,D1,D10,D11,D4,D7
`Chr5:9807794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:9807807`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B130,D5
`Chr5:9807807`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B130,D5
`Chr5:9807858`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	B23,B25,B26,B32,B34,B36,B48,B49,C15,C34,C36,C42,C55,C60,C8,C81,C82
`Chr5:9807907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B97,C14,C35,C6
`Chr5:9808446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B140,C73,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811277.1

420 aa

210

420

Cellulase

GH5_mannosidase

PF00150 Cellulase 79-328 aa PF26410 GH5_mannosidase 94-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811277.1`	Pfam	`PF00150`	Cellulase	Domain	79	328	1.5e-08	35.2	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
`XP_057811277.1`	Pfam	`PF26410`	GH5_mannosidase	Domain	94	367	1.5e-34	120.3	GH family 5 beta-mannosidase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955294.1
ATGAAGCTCAGCTTACTCGCGAGTCACATTGGAGGGAGAAAAAACTGTACCCGACTCTGCCTTTTGTACCTCAACTTGTACGGTCATCTTGATTTCCATTTTCCGGTGGTGGTGCCGGAGATGGGATTCGTCGGCACCAGATTCGTGGTCCTCCAAGACCAAGAGCAGCAGGAGGAGTTTTACGTGAACGGGTGGAATTCGTATTGGTTGATGAGCCTGCAGGAGAGCATGCGGGCCCCATCCAAATGGGCTTTGAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025499
ATGAAGCTCAGCTTACTCGCGAGTCACATTGGAGGGAGAAAAAACTGTACCCGACTCTGCCTTTTGTACCTCAACTTGTACGGTCATCTTGATTTCCATTTTCCGGTGGTGGTGCCGGAGATGGGATTCGTCGGCACCAGATTCGTGGTCCTCCAAGACCAAGAGCAGCAGGAGGAGTTTTACGTGAACGGGTGGAATTCGTATTGGTTGATGAGCCTGCAGGAGAGCATGCGGGCCCCATCCAAATGGGCTTTGAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811277.1
MKLSLLASHIGGRKNCTRLCLLYLNLYGHLDFHFPVVVPEMGFVXGTRFVVLQDQEQQEEFYVNGWNSYWLMSLQESMRAPSKWALSDGSPPNALQLRPAVFHQTLFQALDYVLVEARRQGIRIILSLVNNLNAYGGKAQYVRWAKEAGLIVSSSTDSFFSHPIIKAYYKAYVKAILSRKNYFTGVKYSDEPSIFAWALINEPRCESVSCASDLQAWITEMAAFVKSLDQKHLVMVGLEGFYSSKSNENYGANPGNWAAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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