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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001172`

染色体: Chr05 坐标: 9821750-9823101 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001172`
名称	SmilChr05G001172
描述	acyl-CoA--sterol O-acyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9821750 - 9823101 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985869`
GeneID	`130985869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985869`
原始查询	`SmilChr05G001172`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acyl-CoA--sterol O-acyltransferase 1-like
产物	acyl-CoA--sterol O-acyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G51970` (ASAT1) acyl-CoA sterol acyl transferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824360] identity=40.6; qcov=0.922; evalue=8.36e-70; confidence=medium
Rice	`Os04g0481900` (OsWS1) - identity=31.8; qcov=0.898; evalue=2.02e-34; confidence=low
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374)
KEGG	-
Pfam	PF13813 (MBOAT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057765014.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057765014.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765014.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765014.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9821874`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B102,B125,B77,D10
`Chr5:9821874`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B102,B125,B77,D10
`Chr5:9821952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:9821985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B55
`Chr5:9822035`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B13,B35
`Chr5:9822035`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B13,B35
`Chr5:9822049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:9822165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:9822171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:9822183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C23
`Chr5:9822191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:9822225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B37,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765014.1

374 aa

187

374

MBOAT_2

PF13813 MBOAT_2 201-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765014.1`	Pfam	`PF13813`	MBOAT_2	Family	201	284	3e-15	56.9	Membrane bound O-acyl transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909031.1
TCAACCTACAGAAATTTAGGGCTCTCAAACATTGCATGACTTGTTTTACATATATTTTTAATTTAGATCCCAAATAGCTCAGGTTTACTTCACTCTGCTTCGTAAAAATATAGGCAGAATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAAATAGATATGGAAGAAGAGATGAACAATTTTATTATGGTATGGTTCACAGTTGCTATGTCGTCATGCTACTGCTATGGTACAACCAAATTGGTCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985869
ATGGAAATAGATATGGAAGAAGAGATGAACAATTTTATTATGGTATGGTTCACAGTTGCTATGTCGTCATGCTACTGCTATGGTACAACCAAATTGGTCCCAAAAGGTACAATCAGATTCTTGCTGTTCTTGCCTGCGCTATGCCTTCTCTACATTCTTCCTCTCTATTTAAAGGCTCTCATTTTTAGTATTCCAACTGCTTTCTTTGTAACATGGCTAACCTCATTCAAGCTTCTACTATTGGTTTTTGACAGTGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765014.1
MEIDMEEEMNNFIMVWFTVAMSSCYCYGTTKLVPKGTIRFLLFLPALCLLYILPLYLKALIFSIPTAFFVTWLTSFKLLLLVFDSGPLSTPSLSLIHFLTIYCLPIKLQKPTSPTKQNGPYKQNNQNSVTLNINLGFLIHYAIKGFIFYLLTIVGYNKHMLPQKLASFLICIYAYLGLELSLVAFAMIGRVVLGIEAARPFDHPYLSTSLQDFWGRRWNRVAAGALKSTIFYPTLNGTSRLLGRKWAAIVAAVVTFVVSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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