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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001175`

染色体: Chr05 坐标: 9842817-9847840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001175`
名称	SmilChr05G001175
描述	uncharacterized SmilChr05G001175
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9842817 - 9847840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985870`
GeneID	`130985870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985870`
原始查询	`SmilChr05G001175`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0407900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0407900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G22350` (AT4G22350) Ubiquitin C-terminal hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828330] identity=75.6; qcov=0.953; evalue=7.59e-164; confidence=high
Rice	`Os09g0407900` - identity=83.2; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000245 (spliceosomal complex assembly); GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0006397 (mRNA processing); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00443 (UCH); PF02148 (zf-UBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765015.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057765015.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765016.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765016.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057765015.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9845303`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	91	A13,A14,A21,A23,A24,A25,A4,A7,A9,B1,B10,B101,B103,B105,B108,B110,B111,B117,B118,B121,B122,B123,B128,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B16,B19,B20,B23,B25,B32,B33,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B51,B53,B55,B58,B61,B62,B64,B69,B7,B81,B82,B83,B85,B86,B97,B98,C1,C10,C11,C15,C23,C24,C30,C37,C42,C46,C49,C5,C50,C56,C58,C64,C65,C66,C69,C72,C74,C75,C77,C78,C82,C84,D1,D3,D8
`Chr5:9845833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B33,B45,C24,C75
`Chr5:9847238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B74,B75,D9
`Chr5:9847369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:9847396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C23,C33,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765015.1

548 aa

274

548

zf-UBP

UCH

PF02148 zf-UBP 121-182 aa PF00443 UCH 222-544 aa

XP_057765016.1

344 aa

172

344

UCH

PF00443 UCH 18-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765015.1`	Pfam	`PF02148`	zf-UBP	Domain	121	182	2.6e-19	69.9	Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein
`XP_057765015.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	222	544	4.4e-41	141.9	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057765016.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	18	340	1.1e-41	143.9	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909032.1
GGAATTTTCGTATGAGAACGAAGAAAGAGATTAGAGTTTCTTTCAAAGCCACGTGAAAAAAAATCGAGAGATATAGAGAATAGGGGATTTTCAAAAAGGATGTGAGAAGATTCGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGATTAGTCAAAATGGTGAGAAATGGCATTAGGATTTCGAGGTCTGTGGGCTGCTAATTGGCTTATTATTATATGGTTTAAGTTTTTTTTTTTGTCTAATTTATTTTATACGAAATTGGTTAATTTA...

XM_057909033.1
ATCTCACGCATATACTCATAGTCTTGAAGCTGGCCACCATGTCTACATTAATCTCTGTACAGAGAAAGTTTACTGTCTTCCTGATGGATATGAAGTCATTGATCCATCATTGGATGACATTCGCCATGTACTAAACCCAAGGTTTTCGAGAGAAAGTGTTATTCAGATTGACCAGAATCGTCAATGGTCCAGGGCGCTTGATGGTTCTGATTATCTTCCCGGAATGGTTTTTGATTGAGCCTTTTCTTTGGGTGGGGTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985870
ATGAAAACAGCAAGAGAAGAATCCGAGAATGCTGCTAACGAAGAGGGCGCGCCGAAGAGGCAGAAGCTACTCGATCAATCTTCGCCGCAGCTTGCCTTCGAAAACCCGCTCCTTCCGCTGGCTTCTTACGAAGATGATGAGGAAGAAGTGGAGGATAGGAGAGATGGTGGTAGGGGTAGAGATGTATATGATGGCAAAAGAGAAGGCCTAAATGGGCATACTGAAGATGAAGATGAAGATGATGACGAAGAAAGTAAAAC...

LOC130985870
ATGGTTCTGATTATCTTCCCGGAATGGTTTTTGATTGAGCCTTTTCTTTGGGTGGGGTTAAATAATATCAAAGAGACTGATTTTGTCAATGTTACCATTCAATCTTTGATGCGTGTTACTCCCTTGAGGAACTTCTTTCTTATTCCCGAGAACTATTCCCATTGCAAATCCCAACTTGTTCTCCGATTTGGAGAGCTCACTCGAAAGATCTGGCATGCAAGGAACTTTAAAGGACAGGTCAGTCCGCATGAATTTCTCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765015.1
MKTAREESENAANEEGAPKRQKLLDQSSPQLAFENPLLPLASYEDDEEEVEDRRDGGRGRDVYDGKREGLNGHTEDEDEDDDEESKTGQGRRNRLIEVRRDCPYLDTVNRQVLDFDFEKFCSVSLSNLNVYACLVCGKYFQGRGPKSHAYTHSLEAGHHVYINLCTEKVYCLPDGYEVIDPSLDDIRHVLNPRFSRESVIQIDQNRQWSRALDGSDYLPGMVGLNNIKETDFVNVTIQSLMRVTPLRNFFLIPENYSHCK...

XP_057765016.1
MVLIIFPEWFLIEPFLWVGLNNIKETDFVNVTIQSLMRVTPLRNFFLIPENYSHCKSQLVLRFGELTRKIWHARNFKGQVSPHEFLQAVMKASGKTYRIGAQSDPVRFISWLLQTLHRDLRRSKKGSSIIHQCFQGELEVVKEIHSKHIGEKKENGENGDDGGSEVIMETSKMPFLMLGLDLPPPPLFKDIMEKNIIPQVPLFNILKKFDGETVTEVVRPDTARMRYRVTKLPQYLILHMLRFTRNNFFVEKNPTLVNFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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