当前解析结果
SmilChr05G001177| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001177 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001177 |
| 描述 | rho GDP-dissociation inhibitor 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 9870211 - 9873017 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985874 |
|---|---|
| GeneID | 130985874 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985874 |
| 原始查询 | SmilChr05G001177 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | rho GDP-dissociation inhibitor 1-like |
| 产物 | rho GDP-dissociation inhibitor 1-like |
| Arabidopsis | AT3G07880 (SCN1)Immunoglobulin E-set superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819979] identity=72.9; qcov=0.839; evalue=1.57e-101; confidence=high |
| Rice | Os02g0719000- identity=71.1; qcov=0.804; evalue=3.82e-93; confidence=high |
| GO | GO:0005094 (Rho GDP-dissociation inhibitor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0007266 (Rho protein signal transduction); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02115 (Rho_GDI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985874 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057765020.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057765020.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765020.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765020.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765020.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765020.1PF02115
Rho_GDI 35-222 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765020.1 |
Pfam | PF02115 |
Rho_GDI | Domain | 35 | 222 | 9e-85 | 283.9 | RHO protein GDP dissociation inhibitor |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。