当前解析结果
SmilChr05G001191| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001191 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001191 |
| 描述 | putative MO25-like protein At5g47540 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 9984420 - 9989062 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985888 |
|---|---|
| GeneID | 130985888 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985888 |
| 原始查询 | SmilChr05G001191 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative MO25-like protein At5g47540 |
| 产物 | putative MO25-like protein At5g47540 |
| Arabidopsis | AT5G47540 (AT5G47540)Mo25 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834804] identity=83.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os07g0585100- identity=78.3; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0035556 (intracellular signal transduction); GO:0043539 (protein serine/threonine kinase activator activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08569 (Mo25) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985888 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057765035.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057765035.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057765035.1 |
| 4 | Phragmoplast | Phragmoplast | 0.20000 | XP_057765035.1 |
| 5 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.20000 | XP_057765035.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:9984892 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,D10 |
Chr5:9987347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B111,B55 |
Chr5:9987605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr5:9987615 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C8 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765035.1PF08569
Mo25 4-336 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765035.1 |
Pfam | PF08569 |
Mo25 | Repeat | 4 | 336 | 8.8e-133 | 443.4 | Mo25-like |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。