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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001194`

染色体: Chr05 坐标: 10000531-10002777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001194`
名称	SmilChr05G001194
描述	cytochrome P450 76T24-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10000531 - 10002777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025503`
GeneID	`131025503`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025503`
原始查询	`SmilChr05G001194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 76T24-like
产物	cytochrome P450 76T24-like
Arabidopsis	`AT1G33720` (CYP76C6) cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840263] identity=43.9; qcov=0.542; evalue=1.01e-25; confidence=medium
Rice	`Os10g0167200` - identity=38.4; qcov=0.643; evalue=8.26e-27; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025503

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811280.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057811280.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811280.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811280.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10000598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C23
`Chr5:10000641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B37,C38
`Chr5:10000652`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A14,A15,A16,A20,A25,B107,B127,B130,B21,B22,B36,B51,B53,B59,B63,B66,B73,B86,B88,B9,B91,B95,C26,C27,C28,C33,C45,C47,C52,C55,C75
`Chr5:10000705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:10000782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B104,B110,B133,B85,B86,C1,C17,C64,C66,D8
`Chr5:10000805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B78,C31
`Chr5:10002431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B7,D5
`Chr5:10002461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:10002466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B7,D5
`Chr5:10002478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:10002538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C84
`Chr5:10002595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811280.1

227 aa

114

227

p450

RVT_3

PF00067 p450 1-129 aa PF13456 RVT_3 150-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811280.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	1	129	4.6e-09	36.3	Cytochrome P450
`XP_057811280.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	150	206	5.7e-05	23.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955297.1
ATGGCTCGGGAGATCCTACAGAAGCACGATCAAACATGCTCGAGTAGGACAGTGCCTCACGTGGCCCATGCACTGGGCCACCACGAGGCCTCCGTGGGCTGGCTCCCCGTGGGGAGCAAATGGCGCAAGCTGCGCAAAATCAGCCGAGAGCACATGTTCACAATGCACAAGCTCCAAGCGAGCGCAGCCCTCCGCCAAGATAAGCTGCGGCAACTGCAGGATTTCTTGGCGGAGAGCTGCTCGGAAGGCAGGGTGGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025503
ATGGCTCGGGAGATCCTACAGAAGCACGATCAAACATGCTCGAGTAGGACAGTGCCTCACGTGGCCCATGCACTGGGCCACCACGAGGCCTCCGTGGGCTGGCTCCCCGTGGGGAGCAAATGGCGCAAGCTGCGCAAAATCAGCCGAGAGCACATGTTCACAATGCACAAGCTCCAAGCGAGCGCAGCCCTCCGCCAAGATAAGCTGCGGCAACTGCAGGATTTCTTGGCGGAGAGCTGCTCGGAAGGCAGGGTGGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811280.1
MAREILQKHDQTCSSRTVPHVAHALGHHEASVGWLPVGSKWRKLRKISREHMFTMHKLQASAALRQDKLRQLQDFLAESCSEGRVVNFEEVAFVTALNLISTTMFSVDFARLDSDSSHQEMKEIIQGLMNSDDTDCGCSNRRGFQPTELTDCQQLFWRIFKRENDLSFIGDSLLDIFGRLNRFSLSEISWVPRNENSIADSLAKHALLLRLSGSSCETFPVGFNVLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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