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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001195`

染色体: Chr05 坐标: 10041020-10043793 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001195`
名称	SmilChr05G001195
描述	U-box domain-containing protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10041020 - 10043793 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985892`
GeneID	`130985892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985892`
原始查询	`SmilChr05G001195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 4
产物	U-box domain-containing protein 4
Arabidopsis	`AT4G16490` (AT4G16490) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827347] identity=70; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0584900` (OJ1060_D03.106) - identity=54.7; qcov=0.935; evalue=1.1e-135; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057765042.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765042.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765042.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765042.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10041410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,C23,C25,D11
`Chr5:10041479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:10041490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:10041611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B21
`Chr5:10041764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:10041990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:10042472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B3,B66,C74,C79
`Chr5:10043242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B125,B67,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765042.1

463 aa

232

463

ARM_PUB

Arm

PF25598 ARM_PUB 193-451 aa PF00514 Arm 209-246 aa PF00514 Arm 291-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765042.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	193	451	8.2e-24	85.3	Plant U-box protein ARM repeat region
`XP_057765042.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	209	246	2.7e-30	104.1	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057765042.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	291	329	2.7e-30	104.1	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909059.1
AGAAATAAATATCATTTTCATAAATAATTACGAATGCGATACTCCCCTATAAAATCCATCCTATCTATCTTTCAGAGCTACTTTCCTCTCTCACTTCAATCCGCCATGGAAATTCCTTGAACCTGCTAAAATCTCAAGCATATAATCACCTCTACTGAAAATCCAAGACTTGGTTTGCTTTCGCTACTCACTCACCATGGTCTCCATAGACGATTCACACTCTCATTCACACTCCAATCCCAACATCAATGCTCGCTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985892
ATGGTCTCCATAGACGATTCACACTCTCATTCACACTCCAATCCCAACATCAATGCTCGCTACAGCTACAACCAAGCTCGCCCCTACTACTACTACACTCCACCGCCGTCCTCCGCCAAGATAAGCCGTTCCATGGGGCGCTCCATGCGCACAATCCGCTCCACCATCTTCAACACCGATCAGTCCGGTCCGGTCTGCGACAAATCGCCCAACCTATCGGAGAATCTCACCGACTCGGTTATCGACCTTCGCCTCGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765042.1
MVSIDDSHSHSHSNPNINARYSYNQARPYYYYTPPPSSAKISRSMGRSMRTIRSTIFNTDQSGPVCDKSPNLSENLTDSVIDLRLGELASKSSTNSKSPSSEDIDDMLDISRAFSDFSACSSDISGELQRLANLPDPALNDGTSSDHEPEPCSGFLQRETFSTEIIESISPEDLQPTVKLCVDGLQSSSIAVKRSAAAKLRLLAKNRADNRALIGESGAVPALIPLLNCSDPMTQEHAVTALLNLSLHDGNKSVITRAGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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