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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001198`

染色体: Chr05 坐标: 10074248-10078168 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001198`
名称	SmilChr05G001198
描述	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10074248 - 10078168 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985894`
GeneID	`130985894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985894`
原始查询	`SmilChr05G001198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
产物	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
Arabidopsis	`AT3G07810` (AT3G07810) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819972] identity=54.6; qcov=1.05; evalue=2.58e-146; confidence=high
Rice	`Os11g0637700` (RBPA) - identity=56.5; qcov=0.994; evalue=2.12e-149; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765046.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765046.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057765046.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057765047.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057765046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10074726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:10075354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:10075438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B101,B70
`Chr5:10075482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B19,B2,B79
`Chr5:10075874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765046.1

485 aa

242

485

RRM_1

PF00076 RRM_1 8-74 aa PF00076 RRM_1 112-168 aa

XP_057765047.1

476 aa

238

476

RRM_1

PF00076 RRM_1 8-74 aa PF00076 RRM_1 112-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765046.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	8	74	8.4e-33	112.8	RNA recognition motif
`XP_057765046.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	112	168	8.4e-33	112.8	RNA recognition motif
`XP_057765047.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	8	74	8e-33	112.8	RNA recognition motif
`XP_057765047.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	112	168	8e-33	112.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909063.1
CAAAAATATGAGAAACAGCCTAGTCACCATTTCCATCTTCTCCTCTCCTACATTTCTTACACGAGAGAGGATAGCCAAAGAGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACAATATATGTATAAACTATATATACAGAAATACTTATATTTCGCACACAACACACGCACATATCGACTCCTATATTTACCCATTTTGGATGTGAAAATCGATCTCTACGGGCCACACCATCTTGGTTTTCTCTCTCTATCACATAACA...

XM_057909064.1
ACAGCCTAGTCACCATTTCCATCTTCTCCTCTCCTACATTTCTTACACGAGAGAGGATAGCCAAAGAGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACAATATATGTATAAACTATATATACAGAAATACTTATATTTCGCACACAACACACGCACATATCGACTCCTATATTTACCCATTTTGGATGTGAAAATCGATCTCTACGGGCCACACCATCTTGGTTTTCTCTCTCTATCACATAACACAGAATATATATAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985894
ATGGAAATGGAACCGGGGAAGCTATTCATTGGTGGGATCTCTTGGGACACGAGTGAGGAGCGTTTGAGAGAGTATTTTCAAACTTTTGGTGAAGTAGTCGAAGCTGTGATCATGAAGGATCGCGCCACTGGCCGTGCCCGTGGTTTTGGTTTCATCGTTTTTGCTAATGCTTCTGTTGCTGAGAAAGTTGTCAAGGAAAGGCACGTCATAGATGGAAGAACTGTGGAGGCAAAGAAGGCTGTTCCTAGGGATGATCATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765046.1
MEMEPGKLFIGGISWDTSEERLREYFQTFGEVVEAVIMKDRATGRARGFGFIVFANASVAEKVVKERHVIDGRTVEAKKAVPRDDHQNYNRNSVSIHGSIQGSPGPVRTKKIFVGGLASSVTESDFKRYFDQFGTITDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYDLEEAVDKVLFKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGSTRNQPSGYNYGLNRVSSFLNTYSPGHNSSSPSGYGMRMDGRFSPVAVGRSGYSPYSMANMGLNSDS...

XP_057765047.1
MEMEPGKLFIGGISWDTSEERLREYFQTFGEVVEAVIMKDRATGRARGFGFIVFANASVAEKVVKERHVIDGRTVEAKKAVPRDDHQNYNRNSVSIHGSIQGSPGPVRTKKIFVGGLASSVTESDFKRYFDQFGTITDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYDLEEAVDKVLFKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGSTRNQPSGYNYGLNRVSSFLNTYSPGHNSSSPSGYGMRMDGRFSPVAVGRSGYSPYSMANMGLNSDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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