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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001205`

染色体: Chr05 坐标: 10143769-10147499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001205`
名称	SmilChr05G001205
描述	OBERON-like protein
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10143769 - 10147499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985901`
GeneID	`130985901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985901`
原始查询	`SmilChr05G001205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OBERON-like protein
产物	OBERON-like protein
Arabidopsis	`AT5G48160` (OBE2) potyvirus VPg interacting protein (DUF1423) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834868] identity=64.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0514400` - identity=60.2; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF07227 (PHD_Oberon); PF16312 (Oberon_cc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765055.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765055.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765055.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765055.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10145603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B58,C82
`Chr5:10145628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B118,B7,C11,C69
`Chr5:10145640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:10145726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C15
`Chr5:10145726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:10145734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B29,D8
`Chr5:10145860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:10145920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B21,B87
`Chr5:10146229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B21,B87
`Chr5:10146722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:10146966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B37
`Chr5:10147182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B21,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765055.1

581 aa

290

581

PHD_Oberon

Oberon_cc

PF07227 PHD_Oberon 214-337 aa PF16312 Oberon_cc 430-562 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765055.1`	Pfam	`PF07227`	PHD_Oberon	Family	214	337	4.7e-41	140.4	PHD - plant homeodomain finger protein
`XP_057765055.1`	Pfam	`PF16312`	Oberon_cc	Coiled-coil	430	562	7.1e-50	169.0	Coiled-coil region of Oberon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909072.1
CTTCCTAATGCGGCACAACTCAGATTTTTCTTCTTCTTTTTATTTTTTATTTTCTTTTCCGAATTCATTTACGCTTTAGCTTTACCGGGTCAAATGCTTCAAACCAGAGGACTTCCCCACAACAACACCGCAAAATCTCTGCTGGGTTAGGGTTTCTACTTTCAATCGGGAAGAAAAGCTCAACTTGTCAATCGAGGCGGAGATTCAAATTTAATCCCTTCGAAAACACCACTTACGCAGATTGTGCTTCAATTTTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985901
ATGGGGACATCCTCTGGAGCTCATATCAATGACCAATCATCAATGCTGCCTCCTCGGCAACAGCCACGGTCTGGAGGAGGTGGGCTTCAGACATCCCTCTCCTTGGTCTCTTCAGATGCCTGTGGATCTCCAAATCTTCATGAGCGCGGCTCAAATTCTGATCAGGTCCGGGAATCGCCATCTGAAAGTGCTAGTTCCAGAGAAACTTGGCCCACTGCTGATGCTTTGGTAGCGAAGAGACTGGAGAAGGAAAAAGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765055.1
MGTSSGAHINDQSSMLPPRQQPRSGGGGLQTSLSLVSSDACGSPNLHERGSNSDQVRESPSESASSRETWPTADALVAKRLEKEKERENGFAEQSVMQHVASSDKLCLMDVARERVEIIAERMQNLPDEYLEKFKNELRASLEGLGGSQQREEFLFFQKMVQSRGDLTDKTLIMAHRVQLEILVAMKTGIQAFLHPSVSLSQASLIDIFLYRRCRNIACGSTLPAEDCACELCSRRNGFCNLCMCVICNTFDFEVNTCRW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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