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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001209`

染色体: Chr05 坐标: 10173052-10178624 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001209`
名称	SmilChr05G001209
描述	protein NAR1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10173052 - 10178624 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985906`
GeneID	`130985906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985906`
原始查询	`SmilChr05G001209`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NAR1
产物	protein NAR1
Arabidopsis	`AT4G16440` (NAR1) ferredoxin hydrogenase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827338] identity=69; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0748700` (OsISC38) - identity=69.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF02256 (Fe_hyd_SSU); PF02906 (Fe_hyd_lg_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765065.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765065.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765065.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057765066.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765066.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10175136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:10176171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B117,B46,D1
`Chr5:10176713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:10177093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B8,C15
`Chr5:10178238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765065.1

462 aa

231

462

Fe_hyd_lg_C

Fe_hyd_SSU

PF02906 Fe_hyd_lg_C 84-387 aa PF02256 Fe_hyd_SSU 415-450 aa

XP_057765066.1

396 aa

198

396

Fe_hyd_lg_C

Fe_hyd_SSU

PF02906 Fe_hyd_lg_C 18-321 aa PF02256 Fe_hyd_SSU 349-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765065.1`	Pfam	`PF02906`	Fe_hyd_lg_C	Domain	84	387	3.3e-85	286.7	Iron only hydrogenase large subunit, C-terminal domain
`XP_057765065.1`	Pfam	`PF02256`	Fe_hyd_SSU	Domain	415	450	7e-13	49.1	Iron hydrogenase small subunit
`XP_057765066.1`	Pfam	`PF02906`	Fe_hyd_lg_C	Domain	18	321	2.3e-85	287.2	Iron only hydrogenase large subunit, C-terminal domain
`XP_057765066.1`	Pfam	`PF02256`	Fe_hyd_SSU	Domain	349	384	5.6e-13	49.4	Iron hydrogenase small subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909082.1
AGAATACTAATTCTCCTACCTGCTCTGCCGCCACACCCACCCACCTCCAGGCTCCATCCACACGCCCCGCCCCACAGTCCCACACAGCTTCGGCCTCCCCTCCTCGCCGCGACGCCGCCCCTATTGCTGACTGCTGAGCAATCGTACACTACACAAACTACGATAATGTCGGAGAGATTTTCTGCTACGCTCAGAATTGGTGACTTGAACGATTACATAGCTCCATCACAAGGTTGCGTCATTAAAACTGAGAATTCTGG...

XM_057909083.1
CGTCATTAAAACTGAGAATTCTGGTAAATCAAGGATGGTTCCTAAAGCAGCTCAGACGGAGCCTGTGAAGATCTCACTCAAGGACTGCTTAGCATGCAGGGGAAGAACAGAGGGAGAGGAGAAATCGAAAAGAATAATGGAACACTAATGTTCATGATTCTCATGCAGTGGGTGCATAACTTCCGCAGAAACAGTTATGCTTGAGAAGCAGAGTTTAGATGAGTTTCTTTTGAACCTCAACAAAGGAAAAGCTGTAATTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985906
ATGTCGGAGAGATTTTCTGCTACGCTCAGAATTGGTGACTTGAACGATTACATAGCTCCATCACAAGGTTGCGTCATTAAAACTGAGAATTCTGGTAAATCAAGGATGGTTCCTAAAGCAGCTCAGACGGAGCCTGTGAAGATCTCACTCAAGGACTGCTTAGCATGCAGTGGGTGCATAACTTCCGCAGAAACAGTTATGCTTGAGAAGCAGAGTTTAGATGAGTTTCTTTTGAACCTCAACAAAGGAAAAGCTGTAAT...

LOC130985906
ATGCTTGAGAAGCAGAGTTTAGATGAGTTTCTTTTGAACCTCAACAAAGGAAAAGCTGTAATTTTCTCCCTTTCTCCCCAGTCTAGGGCTTCTCTTGCTGTTCATTTTGGCCTTTCTCCCCTTCAGGTATTTCAGAAACTTACAACATTGTTGAAGTCTTTGGGAGTGAAAGCCATTTTTGATACTAGCAGCAGTCGAGATTTAACACTTATCGAGTCTTGTAATGAATTCATAGCTCGCTATAGAGAAAGCAATTCAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765065.1
MSERFSATLRIGDLNDYIAPSQGCVIKTENSGKSRMVPKAAQTEPVKISLKDCLACSGCITSAETVMLEKQSLDEFLLNLNKGKAVIFSLSPQSRASLAVHFGLSPLQVFQKLTTLLKSLGVKAIFDTSSSRDLTLIESCNEFIARYRESNSASEEKSKSALPMISSACPGWICYAEKTLGSYILPHISSVKSPQQTIGAAIKNHICQELCIRPEDIYHVTVMPCYDKKLEAARDDFMFQSDSDAERITEVDSVLTTGEV...

XP_057765066.1
MLEKQSLDEFLLNLNKGKAVIFSLSPQSRASLAVHFGLSPLQVFQKLTTLLKSLGVKAIFDTSSSRDLTLIESCNEFIARYRESNSASEEKSKSALPMISSACPGWICYAEKTLGSYILPHISSVKSPQQTIGAAIKNHICQELCIRPEDIYHVTVMPCYDKKLEAARDDFMFQSDSDAERITEVDSVLTTGEVLDLIKMKSIDFTTLEDSPVDKLLSNVDEGGNLYGVSGSSGGYADTIFRYAAKMLFRKEIEGPLEYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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