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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001216`

染色体: Chr05 坐标: 10215875-10216327 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001216`
名称	SmilChr05G001216
描述	uncharacterized SmilChr05G001216
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10215875 - 10216327 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025504`
GeneID	`131025504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025504`
原始查询	`SmilChr05G001216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G20520` (AT4G20520) RNA binding / RNA-directed DNA polymerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827800] identity=38.3; qcov=0.54; evalue=1.8e-09; confidence=low
Rice	`Os11g0672600` - identity=42.1; qcov=0.933; evalue=2.74e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811281.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811281.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811281.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811281.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811281.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10215876`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr5:10215876`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr5:10215967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr5:10215999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr5:10216042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C56
`Chr5:10216044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B136,C13,C24,D11
`Chr5:10216057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C56,C74
`Chr5:10216080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B136,C13,C24,D11
`Chr5:10216100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B132,B73,C56,C74
`Chr5:10216143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B73,C56,C74
`Chr5:10216192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B136,C13
`Chr5:10216248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811281.1

150 aa

150

RVT_1

PF00078 RVT_1 37-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811281.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	37	143	2.5e-15	57.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955298.1
ATGAAAAGGTGTTGGGAAATCATCAAGGAAGACCTGCTCAAAGTCTTAAAGGAGTTTCACGCTAATGGAAAGCTTACAAGAGGTTGTAACACCGCCTTTGTGGTCTTAATACCGAAGAAAACTGCAGCGTCGGAGCTAAAAGACTACATGCCCATTTCACTTATTAACAGCCTTTACAAGGTGTTGGCTAAAGTTCTTGCTCTTAGAATGAAAAAGGTGATGAATCTCATTATTTCAGAAAGACAGAGCGCTTTTGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025504
ATGAAAAGGTGTTGGGAAATCATCAAGGAAGACCTGCTCAAAGTCTTAAAGGAGTTTCACGCTAATGGAAAGCTTACAAGAGGTTGTAACACCGCCTTTGTGGTCTTAATACCGAAGAAAACTGCAGCGTCGGAGCTAAAAGACTACATGCCCATTTCACTTATTAACAGCCTTTACAAGGTGTTGGCTAAAGTTCTTGCTCTTAGAATGAAAAAGGTGATGAATCTCATTATTTCAGAAAGACAGAGCGCTTTTGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811281.1
MKRCWEIIKEDLLKVLKEFHANGKLTRGCNTAFVVLIPKKTAASELKDYMPISLINSLYKVLAKVLALRMKKVMNLIISERQSAFVEGRCILDGVVTLNEIVEEAKRKKKGTILFKDDFAKAYDTVDWHFLDKMLEKMNFREKSLQEKRQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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