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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001220`

染色体: Chr05 坐标: 10236076-10238053 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001220`
名称	SmilChr05G001220
描述	two-pore potassium channel 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10236076 - 10238053 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985917`
GeneID	`130985917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985917`
原始查询	`SmilChr05G001220`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-pore potassium channel 1
产物	two-pore potassium channel 1
Arabidopsis	`AT5G55630` (KCO1) Outward rectifying potassium channel protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835657] identity=57.4; qcov=0.864; evalue=9.73e-115; confidence=high
Rice	`Os03g0752300` (TPKA) - identity=49.4; qcov=1; evalue=1.71e-104; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0022841 (potassium ion leak channel activity); GO:0030322 (stabilization of membrane potential); GO:0071805 (potassium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00520 (Ion_trans); PF07885 (Ion_trans_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057765077.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057765077.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765077.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765077.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10236848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:10236896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:10237054`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr5:10237054`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr5:10237098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C40
`Chr5:10237178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B89,C16,C76
`Chr5:10237183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr5:10237249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B131,B140,B37,C2
`Chr5:10237251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B82,B83,C15,C5,C84
`Chr5:10237318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B5,B74,C13
`Chr5:10237322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:10237379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765077.1

337 aa

168

337

Ion_trans_2

Ion_trans

Ion_trans_2

PF07885 Ion_trans_2 66-143 aa PF00520 Ion_trans 74-143 aa PF07885 Ion_trans_2 184-257 aa

XP_057765078.1

337 aa

168

337

Ion_trans_2

Ion_trans

Ion_trans_2

PF07885 Ion_trans_2 66-143 aa PF00520 Ion_trans 74-143 aa PF07885 Ion_trans_2 184-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765077.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	66	143	2.7e-31	108.0	Ion channel
`XP_057765077.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	74	143	6.8e-11	42.5	Ion transport protein
`XP_057765077.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	184	257	2.7e-31	108.0	Ion channel
`XP_057765078.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	66	143	2.7e-31	108.0	Ion channel
`XP_057765078.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	74	143	6.8e-11	42.5	Ion transport protein
`XP_057765078.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	184	257	2.7e-31	108.0	Ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909095.1
CTCCGAGATCCAAAAATTTATTATCTCTAGTTTCAAGATTCATACTATAAAATACTTCTATTACTTTTCTCCTTTTCCCTTATTTGATCTCTACTATCTTGTTTATATATATAATTTCCTATTTATAGCCCTTCACCATCATATATTTCGGGTTTGCTTCATCCAAAACAGTGCGGTTTTAATGTTCAAATCAATCTGCGGATCGTTCAGGTGCCGGAAGCAAGAAAGTTGGTAATTTCAGTTGCTCAAAATTATAGAAA...

XM_057909094.1
TCCGAGATCCAAAAATTTATTATCTCTAGTTTCAAGATTCATACTATAAAATACTTCTATTACTTTTCTCCTTTTCCCTTATTTGATCTCTACTATCTTGTTTATATATATAATTTCCTATTTATAGCCCTTCACCATCATATATTTCGGGTTTGCTTCATCCAAAACAGTGCGGTTTTAATGTTCAAATCAATCTGCGGATCGTTCAGGTGAGGTGCCGGAAGCAAGAAAGTTGGTAATTTCAGTTGCTCAAAATTATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985917
ATGGCTAAGAATGAAGCCGAAGATCCATTACTAGAAGAAGCTGTGGGATCTTCGCTCCGTTCTAGTCGGAGCAATGCCTTAATGAAGAGAAGATATCGCCACAGCAAGAGCGTTTCCCCTGCAGAGCAAAACCTGCAGCTTCAGCATCCCGACTCAATCACTGATAACAAGCTCGATCCAAAGCTAGTCCTCTTGATCTTGCTCTCATACATCACTGCAGGAGCCCTATGCTTCTTTCTGGTTAGGTATCAGATCAAGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765077.1
MAKNEAEDPLLEEAVGSSLRSSRSNALMKRRYRHSKSVSPAEQNLQLQHPDSITDNKLDPKLVLLILLSYITAGALCFFLVRYQIKGNKTNGVIDAIYLCVVTMTTVGYGDLVPDSTMSKLLACIFVFVGMALVGLLLSKAVDDIVENQEVFLVRVMHLRDKCEMLKEVETNKVKYKFLTVLIALAMFMIAGTLFLYQKEGLDFFDAVYCVCSTITTLGYGDKSFSTAGGRVFASFWILMSTICLAQFFYSLAELYTERR...

XP_057765078.1
MAKNEAEDPLLEEAVGSSLRSSRSNALMKRRYRHSKSVSPAEQNLQLQHPDSITDNKLDPKLVLLILLSYITAGALCFFLVRYQIKGNKTNGVIDAIYLCVVTMTTVGYGDLVPDSTMSKLLACIFVFVGMALVGLLLSKAVDDIVENQEVFLVRVMHLRDKCEMLKEVETNKVKYKFLTVLIALAMFMIAGTLFLYQKEGLDFFDAVYCVCSTITTLGYGDKSFSTAGGRVFASFWILMSTICLAQFFYSLAELYTERR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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