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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001223`

染色体: Chr05 坐标: 10259353-10262894 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001223`
名称	SmilChr05G001223
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g19850-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10259353 - 10262894 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985921`
GeneID	`130985921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985921`
原始查询	`SmilChr05G001223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g19850-like
产物	BTB/POZ domain-containing protein At3g19850-like
Arabidopsis	`AT3G19850` (AT3G19850) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821522] identity=57.7; qcov=0.642; evalue=2.13e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0674300` - identity=62.1; qcov=0.636; evalue=6.62e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765082.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057765082.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765082.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765082.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10259840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr5:10259846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A2,A24,A5,A6,A8,B107,B13,B38,B54,B63,B65,B68,B73,B77,B79,B86,C16,C22,C33,C34,C37,C50,C60,D1,D5
`Chr5:10259851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B28,B71,C9
`Chr5:10259866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B65,C40
`Chr5:10259903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B46,B98,C21,C83
`Chr5:10259908`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A22,B119,B135,B24,B41,B62,C1,C19,C49,C80
`Chr5:10259962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:10259980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C2,D5
`Chr5:10259987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B82,C15,C30,C52
`Chr5:10259995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C31
`Chr5:10259999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C22
`Chr5:10260011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765082.1

162 aa

162

NPH3

PF03000 NPH3 1-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765082.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	1	99	1.4e-24	87.8	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909099.1
ACTAGGTTTTCATCCAATATTTTCACAGGCGAATCAATTCCTAAAAACATTTCTCACATTCTTAATTCGTTGTTTTCACATTCATCGGTTCAAAGAGCATTTTTTCTGGGCATTTTCCAGACTCTCGAAATCAACGAAACACGGCAAATCTGATTGCTCATTTTAGGGGGCTGTTTTGGGTGTTGAAGCTAGTCTCCGGGTTCGGGATTAGCCGGGAGAGAGCGGCTGATCGGAGGGATGCTCGATCAGGCGAAGCTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985921
ATGCTCGATCAGGCGAAGCTAGACGACTTGCTGGTGTTCGGCGGCGGTGGCGACGGAGGCGGAGGCGGAGTGTATGATGTGAATTTGGTGGTGAGGTTGGTCAGATTGTTCGTGTATGATAACATGTCAATGGAGAGGATGGTGAAAGTAGGGTTTCTGATTGATATGTATTTGGGGGAGATTGGGCCTGATCCTACCCTCAGATTCACTAAGTTTCTTGTTGTTGCTGAGAGTTTGCCTGATTGTGCAAGGGATTCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765082.1
MLDQAKLDDLLVFGGGGDGGGGGVYDVNLVVRLVRLFVYDNMSMERMVKVGFLIDMYLGEIGPDPTLRFTKFLVVAESLPDCARDSFDQVYRAIDIYLQILNRLLAMRSWYQATKKRNTVKVSMKIRQSERFRNLAAPVKMGGSKDQSIEHELVKHKTIRMG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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