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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001234`

染色体: Chr05 坐标: 10461859-10464092 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001234`
名称	SmilChr05G001234
描述	DNA oxidative demethylase ALKBH2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10461859 - 10464092 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985932`
GeneID	`130985932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985932`
原始查询	`SmilChr05G001234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA oxidative demethylase ALKBH2
产物	DNA oxidative demethylase ALKBH2
Arabidopsis	`AT2G22260` (ALKBH2) oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816759] identity=64.8; qcov=0.955; evalue=1.24e-111; confidence=high
Rice	`Os06g0286310` - identity=48.4; qcov=0.262; evalue=1.45e-16; confidence=weak
GO	GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF13532 (2OG-FeII_Oxy_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765097.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057765097.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057765097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10462298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:10462420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:10462421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B138,B18,B97
`Chr5:10462436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:10462452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr5:10462712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:10463392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B129,C25
`Chr5:10463402`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B97,C79
`Chr5:10463402`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B97,C79
`Chr5:10463403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B22
`Chr5:10463504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:10463545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765097.1

244 aa

122

244

2OG-FeII_Oxy_2

PF13532 2OG-FeII_Oxy_2 38-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765097.1`	Pfam	`PF13532`	2OG-FeII_Oxy_2	Domain	38	241	2.9e-33	116.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909114.1
TTGACGTGGATTAAATCATGTCAATTAGCCCGATGGCAAAAACCTCATTCATATATATCCACAAAGATTCATGAGCTCTTTAACAATTATTCAATTAAGGAGGATTTTACAAGGCAATTTGTTATCCACTTATCTCCTTATTTTGTTAATGCTATAAACAAAACGTTGCATCATAAATAAGTACTGGCAAACGAAGCGATGGTGATATCCTAGATTCTGATTCTGTAACCCTCCACCTCCACCTCCAGCCATTGCAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985932
ATGTCGGCCCGCCTCTTGCAGCAACACGATCCGGTTGAGGAAAATTCAACACCCGAGAAACCTAAGAAGGTGGTGGAGTTGGATTTAGGTAGCGGCAGTCGGATTCTACAGATGCCACGGTTCATCTCATACCAACATTCGTGGAACTATTTCGAATACCTCGATCAAACCATCCCTTGGACCCGACCCACTATCCGCGTTTTTGCGCGCTCACATCTCCAGCCCAGGGACACGTGCTACGTCGCAGCTGAGGGATTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765097.1
MSARLLQQHDPVEENSTPEKPKKVVELDLGSGSRILQMPRFISYQHSWNYFEYLDQTIPWTRPTIRVFARSHLQPRDTCYVAAEGLPQLVYSGYNPHAYSWDEFPPLKEILDMVHKALPGSSFNSLLLNRYKGGNDYVGWHADDEKLYGPTPQIASVSFGCERDFLLKKKPCKSARAKSAERCEGEPPSKRAKKLNNNDQHAFVLKHGSLLVMSGYTQRDWLHSVPKRAKAESTRINLTFRRIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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